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标题: 嵌段聚合物自组装用Gromacs的全原子或联合原子力场可以做吗？ [打印本页]

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Author: lishen123 时间: 2023-8-14 13:57
标题: 嵌段聚合物自组装用Gromacs的全原子或联合原子力场可以做吗？
请问老师做嵌段聚合物的自组装用Gromacs可以做吗？看到别人的文章里面有用DPD耗散粒子动力学做的。这个可不可以在Gromacs里面用全原子或联合原子力场做呢？

作者
Author: slxc920113 时间: 2023-8-14 14:46
比较困难，容易长时间陷在某些结构极小点出不来，需要跑的步数太多了。

作者
Author: lishen123 时间: 2023-8-14 15:03

slxc920113 发表于 2023-8-14 14:46
比较困难，容易长时间陷在某些结构极小点出不来，需要跑的步数太多了。

谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-15 04:05
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性，仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题 “嵌段聚合物自组装” 改了，以后务必注意

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-15 04:07
但凡用DPD、粗粒化模型的，原理上一律可以用联合原子或全原子力场去做，没有例外
只不过是是否算得动的问题，这完全要看自身条件，没计算资源的前提下问这个没意义

作者
Author: lishen123 时间: 2023-8-15 09:24

sobereva 发表于 2023-8-15 04:05
如置顶的新社员必读贴、论坛首页的公告栏、版头的红色大字非常明确所示，求助帖必须在帖子标题明确体现出此 ...

谢谢老师，下次我提问一定注意

作者
Author: lishen123 时间: 2023-8-15 09:24

sobereva 发表于 2023-8-15 04:07
但凡用DPD、粗粒化模型的，原理上一律可以用联合原子或全原子力场去做，没有例外
只不过是是否算得动的问 ...

谢谢老师解答。

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