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标题: 文献复刻中NPT退火的参数设置问题 [打印本页]

作者
Author: panda123321 时间: 2023-8-16 10:34
标题: 文献复刻中NPT退火的参数设置问题

老师和前辈们好，我最近再对一篇文献进行复刻，做到PACKING后的盒子退火时，看到作者NPT退火设置是这样的： (, 下载次数 Times of downloads: 22) (, 下载次数 Times of downloads: 22) (, 下载次数 Times of downloads: 18)
我想请教各位老师的问题是：时间步长在ms里默认是1fs，直接变动的话会出现错误（Dynamics calculation - Aborting dynamics.An unphysical integration step (>100 Angstroms) has been detected.Try relaxing the structure with geometry optimization, reducing the time step, reducing the temperature or a combination of these.）
作者说的步长1ps怎么实现？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-18 06:03
肯定是笔误，应当是1fs，可以发邮件找作者求证。1ps的步长根本不可能，顶多是每1ps保存轨迹一帧而已。

提问时不要给出中文翻译，毫无意义

作者
Author: panda123321 时间: 2023-8-18 16:58

sobereva 发表于 2023-8-18 06:03
肯定是笔误，应当是1fs，可以发邮件找作者求证。1ps的步长根本不可能，顶多是每1ps保存轨迹一帧而已。

...

好的，谢谢您sob老师，我下次规范提问。

作者
Author: lht921119794 时间: 2024-12-10 22:18
请问楼主解决问题了嘛

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