计算化学公社

标题: 请教：关于径向分布函数RDF的问题 [打印本页]

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-8-26 15:09
标题: 请教：关于径向分布函数RDF的问题
本帖最后由 PHOENIXHMX 于 2023-8-26 15:13 编辑

做完分子模拟后计算O原子的RDF图是这样的，感觉没有收敛，这RDF是正确的吗？这是什么问题导致的？感谢解答

作者
Author: Graphite 时间: 2023-8-26 21:22
只看形状并不奇怪，如果是结构比较有序的材料体系，要完全趋近于1，距离得更长。
不过也没有什么“收敛“或者趋向1的强制要求，只要模拟本身没什么问题，现有的信息能够说明问题即可。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-26 21:28
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http://bbs.keinsci.com/thread-25787-1-1.html）

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-8-28 09:20

sobereva 发表于 2023-8-26 21:28
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http:// ...

不好意思sob老师，我模拟的是氟化钙表面水分子的体系，体系大小为4*4.4*10，然后计算氧原子与钙原子的RDF，这个计算结果是正确的吗？

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-8-28 09:22
这是单个钙原子的RDF，氟化钙的体系计算结果是不是应该和这个比较靠近？

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-8-28 10:27

sobereva 发表于 2023-8-26 21:28
在网上求助计算化学问题的时候必须把问题描述得详细、具体、准确、清楚
http://sobereva.com/620（http:// ...

http://bbs.keinsci.com/forum.php ... D6%B2%BC&page=1
在这个帖子里说固液界面看密度更好，所以我做氟化钙固液界面是不是讨论沿Z轴的水分子密度分布更合适？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-28 16:01

PHOENIXHMX 发表于 2023-8-28 09:20
不好意思sob老师，我模拟的是氟化钙表面水分子的体系，体系大小为4*4.4*10，然后计算氧原子与钙原子的RDF ...

体系中那么多钙离子，程序会计算每个钙离子与氧的rdf，显然每个原子的rdf的峰的位置不同，取平均后看起来自然是一大堆峰
讨论垂直于表面氧原子的密度变化明显更有意义

作者
Author: PHOENIXHMX 时间: 2023-8-29 09:11

sobereva 发表于 2023-8-28 16:01
体系中那么多钙离子，程序会计算每个钙离子与氧的rdf，显然每个原子的rdf的峰的位置不同，取平均后看起来 ...

明白了，谢谢sob老师

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