计算化学公社

标题: genmer-gaussian软件生成团簇的初始构型,怎么对其进行切面,扩胞操作? [打印本页]

作者
Author:
1159042428    时间: 2023-8-28 09:59
标题: genmer-gaussian软件生成团簇的初始构型,怎么对其进行切面,扩胞操作?
想要补充一部分数据,想要做一个金属晶体表面吸附有机物,首先通过genmer-gaussian生成金属团簇的最稳定初始构型,求助怎么对其进行(1.1.1)表面,并进行扩胞操作?

作者
Author:
sobereva    时间: 2023-8-28 11:22
切晶面是对于已有的bulk状态的晶体结构而言的。比如你有Pt的晶胞的cif文件,然后可以通过GaussView等程序切晶面。而你这是团簇,没有对它切晶面的概念。顶多是说一个较大的团簇,里面的某一个面对应某个晶面。
作者
Author:
1159042428    时间: 2023-8-28 11:28
sobereva 发表于 2023-8-28 11:22
切晶面是对于已有的bulk状态的晶体结构而言的。比如你有Pt的晶胞的cif文件,然后可以通过GaussView等程序切 ...

sob老师,那我这个团簇能用来做吸附吗?是不是有点小?例如吸附一个苯,O2等?不做吸附的话做一个金属催化的过渡态能行吗?
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-8-28 15:53
1159042428 发表于 2023-8-28 11:28
sob老师,那我这个团簇能用来做吸附吗?是不是有点小?例如吸附一个苯,O2等?不做吸附的话做一个金属催 ...

如果你用团簇模型代替金属表面,显然簇太小了,边界效应太强
该用什么样的簇看下文的例子
使用量子化学程序基于簇模型计算金属表面吸附问题
http://sobereva.com/540http://bbs.keinsci.com/thread-16532-1-1.html
作者
Author:
1159042428    时间: 2023-8-28 20:52
谢谢,sob老师




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3