计算化学公社
标题:
ELF图分析求助
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作者Author:
哈哈宝
时间:
2016-8-25 10:46
标题:
ELF图分析求助
本帖最后由 哈哈宝 于 2016-8-25 10:50 编辑
根据这个ELF等值线图,是否可以看出,Co原子中心为4个孤电子对?我想证明这一点,之后做了AdNDP用Multiwfn,直接搜1c-2e时,每个Co上 ,这是否说明我对ELF的理解有误,其实应该是每个Co上只有2个孤电子对,求指教! 1 Occ: 1.9718 Atom: 1Co 2 Occ: 1.9693 Atom: 1Co
3 Occ: 1.7795 Atom: 1Co
4 Occ: 1.7524 Atom: 1Co
5 Occ: 1.7259 Atom: 1Co
作者Author:
sobereva
时间:
2016-8-25 11:54
都看不出你这个体系是什么结构,起码给个三维结构图。光从这平面图什么也看不出来
作者Author:
哈哈宝
时间:
2016-8-25 14:18
本帖最后由 哈哈宝 于 2016-8-25 17:26 编辑
@sobereva
不好意思。结构(黄色是Co,绿色是Ge),ELF等值线图是通过两个Co的平面垂直于高的面和通过Ge原子(原子234678)平面的ELF等值线图。连个结构之间的关系是,单体,和公用一个四边形面的共融体。
我认为:
单体中,ELF可以看出Co有5个孤电子对(中间单触),每个Ge原子都有一个孤电子对。Co-Ge之间无明显成键关系,说明电子离域。
共融体中,ELF可以看出,Co只有4个孤电子对(中间单触),而且只有Ge原子234678有孤电子对,共融面上的上下2个Ge原子没有孤对电子。Co-Ge之间无明显成键关系,也存在电子离域。
理解的很浅显,请老师指教!谢谢
作者Author:
sobereva
时间:
2016-8-26 00:58
考察ELF不要作等值线图,要作填色图,或者填色图+等值线图。这比起光用等值线图清楚得多
这种立体的结构,如果只作一个图,一定要作等值面图。平面图是为了进一步展现某些平面的细节特征才去做的。而且平面图还应该作个Ge-Co-Ge平面的图,否则都没法清楚反映Co-Ge的成键特征。
Co-Ge是否成键,算个Mayer键级马上就知道了。
至于孤对电子对什么的,我不认为讨论这个有什么意义。而且Co哪来这么多孤对电子。至多是Co附近有一些孤对电子呆的定域化域,这样不能认为每个这种区域里就正好能几乎包含一对孤对电子。你之前做AdNDP分析,发现单中心轨道占据数才1.752,这也说明将这些电子归到孤对电子是不妥的(你也可以做NBO分析,结论应该类似)。
作者Author:
哈哈宝
时间:
2016-8-26 08:18
sobereva 发表于 2016-8-26 00:58
考察ELF不要作等值线图,要作填色图,或者填色图+等值线图。这比起光用等值线图清楚得多
这种立体的结构, ...
谢谢Sob老师
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