计算化学公社

标题: 使用Multiwfn计算ICSS过程中出现读取特定log文件的特定虚原子失败 [打印本页]

作者
Author: Bellic 时间: 2023-8-31 00:45
标题: 使用Multiwfn计算ICSS过程中出现读取特定log文件的特定虚原子失败

在使用Multiwfn计算ICSS过程中出现读取特定log文件的特定虚原子失败

(, 下载次数 Times of downloads: 44) 鄙人研究的文献中有多个需要计算ICSS的分子，它们都经过了完全相同的计算步骤，但唯独这个分子的计算出现了问题（1）。与其他正常的分子相比，其经计算得到的NICSXXXX.log文件大小相似，结尾也是”Nomal termination...“。第一，二行提及的问题在计算出错的分子的NICS0068.log的显示如下， (, 下载次数 Times of downloads: 40) (, 下载次数 Times of downloads: 48) ，这与正常计算得到的文件描述并无区别。我不大理解“无法在这个文件中加载第3587号虚原子，这个虚原子应对应这个文件的第3695中心”意味着什么。

第三行要求我检查setting.ini文件的设置。 (, 下载次数 Times of downloads: 43) 鄙人眼拙，实在无法看出问题。

烦请诸位老师帮忙。不胜感激！

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-31 00:56
帖子该发哪发哪，发到灌水与杂谈版块做什么，属于严重扰乱论坛讨论秩序
http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html明确强调“帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问，并清楚、准确反映出帖子具体内容，避免有任何歧义和含糊性”，写成“第一次发求助帖，怕有问题还是先在灌水区试试手”同样是严重扰乱论坛讨论秩序。
这次给你改了、移动了，下次再发现这种扰乱论坛秩序的行为直接删帖+扣分处理

作者
Author: sobereva 时间: 2023-8-31 01:11
假设你从来没改过NICSnptlim，在载入这些跑好的out文件之前，格点设置过程必须和当初你产生相应的gjf文件时的格点设置一样（诸如延展距离、格点质量等），否则这次要载入的格点数（Bq数目）显然和out文件里的Bq总数不一样。

此问题下文也都强调过
通过Multiwfn绘制等化学屏蔽表面(ICSS)研究芳香性
http://sobereva.com/216

作者
Author: Bellic 时间: 2023-8-31 02:19

sobereva 发表于 2023-8-31 01:11
假设你从来没改过NICSnptlim，在载入这些跑好的out文件之前，格点设置过程必须和当初你产生相应的gjf文件时 ...

感谢老师指导。判断可能是延展距离前后设置不一致，格点质量由文件数佐证均是中等质量格点（不可能出错）。距离改为11或13Bohr可顺利计算。 (, 下载次数 Times of downloads: 45)

作者
Author: Bellic 时间: 2023-8-31 02:19

sobereva 发表于 2023-8-31 00:56
帖子该发哪发哪，发到灌水与杂谈版块做什么，属于严重扰乱论坛讨论秩序
http://bbs.keinsci.com/thread-93 ...

感谢老师指正，此后一定谨遵论坛规则。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)