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标题: Sc离子的水合二聚体结构优化都不收敛，求助 [打印本页]

作者
Author: KYJY 时间: 2023-8-31 08:59
标题: Sc离子的水合二聚体结构优化都不收敛，求助
卢老师，您好，各位老师好，请教老师我在优化Sc钪离子在水环境下的水合二聚体的时候，体系电荷为+4价，自旋多重度为1，使用的泛函为PBE0，非金属原子O和H为6-31G*，Sc离子为SDD赝势基组，优化完的输出文件显示，都没有收敛，我修改关键词# opt(gdiis,maxstep=3,notrust)，使用的溶剂效应为scrf，再去跑，还是没收敛，但是体系的优化曲线都显示不振荡，请问我可以用这个结构吗？如果要调整关键词，我用opt=calcall，可以吗？输入文件和输出文件上传如下，请各位老师指教，谢谢啦，感激不尽

作者
Author: zjxitcc 时间: 2023-8-31 13:48
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-8-31 13:49 编辑

不要老想着调关键词。初始结构离谱天际，估计是手搭的。建议去晶体库下载对应的cif文件，然后从里面提取出这个双核络合物阳离子。届时若结构优化还有问题，再到本帖来问。

作者
Author: KYJY 时间: 2023-8-31 18:06

zjxitcc 发表于 2023-8-31 13:48
不要老想着调关键词。初始结构离谱天际，估计是手搭的。建议去晶体库下载对应的cif文件，然后从里面提取出 ...

好的，谢谢老师

作者
Author: KYJY 时间: 2023-8-31 18:12
标题: Sc的水合二聚体晶体库下载结构优化L202报错

卢老师，您好，各位老师好，我按您的提示在晶体数据库下载相应的cif文件，# opt=loose genecp scrf pbe1pbe，一提交就运行结束了，显示L202报错，请问老师，这是由于什么问题呢，谢谢老师啦，感激不尽。

作者
Author: KYJY 时间: 2023-8-31 18:13
这个是对应的输入文件和输出文件

作者
Author: KYJY 时间: 2023-8-31 19:19

KYJY 发表于 2023-8-31 18:06
好的，谢谢老师

老师，我通过查验CIF文件，发现4号原子和13原子是另外一个原子的对称操作，我要使用对称化和点群工具吗？我想删除掉其中的一个原子，再此基础上进行建模，发现删除的话，会删掉整个原子，13号原子和4号原子是重叠在一起的，还是我直接从输入文件中删除

作者
Author: wayneLiu 时间: 2023-9-23 21:54
冒昧问一下，因为看到您是做水和金属离子，请问您手上有6水合Zn的结构吗

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