计算化学公社

标题: 计算NMR，输入文件中溶剂的设置 [打印本页]

作者
Author: NB的随风 时间: 2023-9-8 09:46
标题: 计算NMR，输入文件中溶剂的设置
老师们好，最近在计算NMR，对于溶剂的选择有点疑惑，下图是文献对于NMR分析的描述。
1、对于CS2还有d6-acetone哪种是溶剂有点模糊，CS2用英文名称写入，输入文件会报错，d6-acetone是直接用scrf=(smd,solvent=acetone)；
2、还是说这两个都应该写进去？

麻烦老师解答，谢谢！

作者
Author: 乐平 时间: 2023-9-8 10:32
溶剂模型设置先看博文 http://sobereva.com/327

Gaussian16 官网有隐式溶剂模型的参数
https://gaussian.com/scrf/

CS2 应该写 CarbonDiSulfide
至于文献里的 d 6-acetone 应该是 6氘代丙酮，这在 Gaussian 里应该是没有内置参数的。

作者
Author: zjxitcc 时间: 2023-9-8 10:48
（1）隐式溶剂写法不能、无需凭感觉，手册记载无比清楚，看http://gaussian.com/scrf/?tabid=7，二硫化碳是CarbonDiSulfide，氘代丙酮直接用丙酮替代。
（2）你这个不太像原文，咋有的地方空格数目不对，CS2中间还能空一格？氘代丙酮一般写作Acetone-d6，这还倒着写？如果是原文，那也有点不严谨了。

作者
Author: NB的随风 时间: 2023-9-8 14:10

乐平发表于 2023-9-8 10:32
溶剂模型设置先看博文 http://sobereva.com/327

谢谢老师回复，看完您给的链接后，想将CS2以及氘代丙酮当做混合溶剂对输入文件进行以下调整，您看是否有问题
# m062x/6-31g* scf=maxcycl=200 symm=loose NMR scrf(smd,read)

1

0 1
原子坐标

Eps=7.9784
EpsInf=2.4181

作者
Author: NB的随风 时间: 2023-9-8 14:13

zjxitcc 发表于 2023-9-8 10:48
（1）隐式溶剂写法不能、无需凭感觉，手册记载无比清楚，看http://gaussian.com/scrf/?tabid=7，二硫化碳是 ...

感谢老师回复！
1、对于这两个溶剂，我是应该当做混合溶剂进行自定义吗？
2、我的疏忽，图片不是从原文献出处，就是内容一样而已，下次注意这个问题

作者
Author: sobereva 时间: 2023-9-8 15:13

NB的随风发表于 2023-9-8 14:13
感谢老师回复！
1、对于这两个溶剂，我是应该当做混合溶剂进行自定义吗？
2、我的疏忽，图片不是从原文 ...

是

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-9-8 15:48

NB的随风发表于 2023-9-8 07:10
谢谢老师回复，看完您给的链接后，想将CS2以及氘代丙酮当做混合溶剂对输入文件进行以下调整，您看是否有 ...

由文献截图知，氘代丙酮是放在单独的一根毛细管里，再把毛细管放进核磁管里，只是为了锁场用。而化合物是溶于纯的CS2的。所以溶剂应该是纯的CS2，不是CS2和氘代丙酮的混合溶剂。

作者
Author: NB的随风 时间: 2023-9-10 09:05

wzkchem5 发表于 2023-9-8 15:48
由文献截图知，氘代丙酮是放在单独的一根毛细管里，再把毛细管放进核磁管里，只是为了锁场用。而化合物是 ...

谢谢老师回复！
目前我试了试纯CS2和混合溶剂（由于比例不清楚，设置CS2：氘代丙酮=7:3），发现两者差值在0.2ppm左右，混合溶剂更接近实验值，是不是可以说明添加一点氘代丙酮会更理想一些

作者
Author: NB的随风 时间: 2023-9-10 09:06

sobereva 发表于 2023-9-8 15:13
是

谢谢sob老师！

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-9-10 16:04

NB的随风发表于 2023-9-10 02:05
谢谢老师回复！
目前我试了试纯CS2和混合溶剂（由于比例不清楚，设置CS2：氘代丙酮=7:3），发现两者差值 ...

不是，这个0.2ppm是其他因素导致的误差，例如泛函误差、基组误差、非谐性效应等的影响

作者
Author: NB的随风 时间: 2023-9-11 08:30

wzkchem5 发表于 2023-9-10 16:04
不是，这个0.2ppm是其他因素导致的误差，例如泛函误差、基组误差、非谐性效应等的影响

明白了，老师，实在是太感谢了！

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