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标题: 求助:差分电荷密度能否识别转移/极化的电荷属于哪个轨道(s, p, or d) [打印本页]

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liheng    时间: 2023-9-10 22:21
标题: 求助:差分电荷密度能否识别转移/极化的电荷属于哪个轨道(s, p, or d)
本帖最后由 liheng 于 2023-9-10 22:23 编辑

最近投稿的文章,审稿人其中一个问题是:如何区分不同轨道电子对总电荷密度变化的贡献?但是我不知道怎么回。因为做差分电荷密度图时用的CHGCAR没有相关信息啊。是否有其他办法可以判断不同轨道电子对电荷转移的贡献呢




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sobereva    时间: 2023-9-10 22:42
说清楚算的什么体系、用的什么程序
一般来说,这种问题可以对电子转移之前和之后的状态计算原子轨道的布居数,彼此求差,就定量知道各个原子轨道的电子密度分布变化的贡献了
如果用的VASP,具体实现我不清楚。若用CP2K,可以用基于其molden文件用Multiwfn做Mulliken布居分析给出这样的信息。

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liheng    时间: 2023-9-12 03:05
sobereva 发表于 2023-9-10 22:42
说清楚算的什么体系、用的什么程序
一般来说,这种问题可以对电子转移之前和之后的状态计算原子轨道的布居 ...

sob老师,我用的VASP的CHGCAR来计算的差分电荷密度。如果要用cp2k也行,只是您说的做Mulliken布居分析我还不太了解,不过问题应该不大。再简单描述一下我的问题吧。我计算的是铯原子在钼金属上的吸附体系,其中要分析功函数的变化。我在一篇老的PRL(DOI:https://doi.org/10.1103/PhysRevLett.48.1128)里面看到作者做了差分电荷密度图(见下),就牵扯到电荷的转移/极化什么的。然后他说铯在表面吸附时价电子(6s)会向表面极化,而5p电子会向真空极化(也就是和6s的极化相反),然后我在文中就引用了这个结论。再然后审稿人就问通过差分电荷密度图是如何判断5p和6s的极化方向的。我但是我在那篇PRL里面也没有看出作者是如何判断的。
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sobereva    时间: 2023-9-12 16:31
liheng 发表于 2023-9-12 03:05
sob老师,我用的VASP的CHGCAR来计算的差分电荷密度。如果要用cp2k也行,只是您说的做Mulliken布居分析我 ...

这种图太抽象,只能根据原子轨道分布的大致范围、密度差图中的电子密度增/减的区域来猜,远没有布居分析有说服力
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liheng    时间: 2023-9-12 17:32
sobereva 发表于 2023-9-12 16:31
这种图太抽象,只能根据原子轨道分布的大致范围、密度差图中的电子密度增/减的区域来猜,远没有布居分析 ...

好的sob老师,我马上做cp2k计算,但是这个布居分析有没有详细点介绍或者推荐啊?
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sobereva    时间: 2023-9-12 19:45
liheng 发表于 2023-9-12 17:32
好的sob老师,我马上做cp2k计算,但是这个布居分析有没有详细点介绍或者推荐啊?

先产生molden文件
详谈使用CP2K产生给Multiwfn用的molden格式的波函数文件
http://sobereva.com/651http://bbs.keinsci.com/thread-31827-1-1.html

然后给Multiwfn,主功能7的子功能5里面选1,得到各个基函数的Mulliken布居数,按下文了解基函数与原子轨道的对应关系便知道原子轨道布居数
利用布居分析判断基函数与原子轨道的对应关系
http://sobereva.com/418http://bbs.keinsci.com/thread-10094-1-1.html


另外,北京科音CP2K第一性原理计算培训班(http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html)里有完整的分析例子
(, 下载次数 Times of downloads: 3)

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liheng    时间: 2023-9-12 19:49
sobereva 发表于 2023-9-12 19:45
先产生molden文件
详谈使用CP2K产生给Multiwfn用的molden格式的波函数文件
http://sobereva.com/651(h ...

好的,谢谢sob老师





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