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标题: 求助:有机聚合物热解初始反应路径判断 [打印本页]

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TYCHEN    时间: 2023-9-13 10:20
标题: 求助:有机聚合物热解初始反应路径判断
本帖最后由 TYCHEN 于 2023-9-13 14:02 编辑

各位大佬们好,如下图所示,本来是聚合物无氧热解,高分子模型化之后将两边的长链换成了甲基,用pm6计算了各物质的EE+ZPE(kJ/mol)如图中紫色数字所示,其中箭头上的数字指找到的过渡态的能量,箭头上的问号指暂未找到过渡态,”complex“指两种产物在同一个gjf文件里计算的能量(即由TS进行IRC之后将产物那端进行opt得到的能量),现在的问题主要有2个:

1. 箭头上打问号的路径是否存在过渡态?如何找到。
2. 由这些能量的变化,这6种可能的路径中哪条路径是最容易发生的?为什么。如何将各路径的速率常数或反应占比算出来?是否存在其他路径?

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非常感谢各位大佬的无私教导!!!!!

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Graphite    时间: 2023-9-13 11:22
1、自由基反应不是一定有过渡态,不确定的话,沿着断键成键方向做软扫,看看有没有迹象。
2、尽可能全地搜索过渡态,然后算热力学函数,自己对公式也行,用shermo也行。动力学不好算,即使算出来,这个小分子的也不对应实际聚合物中的复杂情况。

另外:
1、不确定这样用甲基替代高分子链,拿放大镜做微观基团反应是否合理。当然这和你的角度有关,就不多说了。
2、就说量化这块,计算级别太低了,PM6粗略优化下没问题,这点分子大小起码杂化泛函+3-zeta基组起步。
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TYCHEN    时间: 2023-9-13 16:01
Graphite 发表于 2023-9-13 11:22
1、自由基反应不是一定有过渡态,不确定的话,沿着断键成键方向做软扫,看看有没有迹象。
2、尽可能全地搜 ...

非常感谢您的回复!R2.4、R2.5、R2.6是脱去一个H的反应,想请问下这种简单的单纯脱去一个氢原子是一定没有过渡态吗?我柔性扫描出来结果发现脱掉了两个H,两个H变成H2了,那现实中到底是什么情况呢?(我本来的思路是脱去一个H原子,然后出现一个自由基,再自由基β解离)
用PM6确实是粗估。
out文件超内存了上传不了,如下图
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Graphite    时间: 2023-9-13 21:59
TYCHEN 发表于 2023-9-13 16:01
非常感谢您的回复!R2.4、R2.5、R2.6是脱去一个H的反应,想请问下这种简单的单纯脱去一个氢原子是一定没 ...

这得拿正经DFT算下,而且扫出来的是个吸热非自发反应,也挺反常识。热解反应势能面上可能性太多,只是凭化学经验的话,可能会陷进去。如果量化手动挡实在做不透,不妨AIMD乃至REAXFF跑一段时间,会得到些有用信息。




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