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标题: 求助,cube文件在VMD显示不了轨道,但在VESTA里可以正常显示。 [打印本页]

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不会扣篮的后卫    时间: 2023-9-13 11:11
标题: 求助,cube文件在VMD显示不了轨道,但在VESTA里可以正常显示。
请问各位老师,同学。我有一个通过QE生成的cube文件,1_oH.cube。这个cube文件可以通过VESTA打开,可以看到带有轨道的效果图。
但是通过VMD打开,却看不到任何轨道,只有分子结构。附上1_oH.cube供大家参考。请问大家有什么建议,让这个cube文件可以在VMD里显示轨道效果图?

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卡开发发    时间: 2023-9-13 13:53
可以显示,你体素数据可能值比较小,等值面设置<1e-4这个量级试试看。
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sobereva    时间: 2023-9-13 22:54
VMD载入cub文件本身就不会自动显示出等值面。必须在Graphics - representation里进行相应的设置。图省事可以用下文的脚本,十分方便
在VMD里将cube文件瞬间绘制成效果极佳的等值面图的方法
http://sobereva.com/483http://bbs.keinsci.com/thread-13329-1-1.html
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不会扣篮的后卫    时间: 2023-9-14 03:04
卡开发发 发表于 2023-9-13 13:53
可以显示,你体素数据可能值比较小,等值面设置

谢谢老师!
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不会扣篮的后卫    时间: 2023-9-14 03:05
sobereva 发表于 2023-9-13 22:54
VMD载入cub文件本身就不会自动显示出等值面。必须在Graphics - representation里进行相应的设置。图省事可 ...

谢谢卢老师!




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