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标题: 求助：gromacs用gmx rdf计算9(r)和配位数 [打印本页]

作者
Author: 打豆豆的灰鸭 时间: 2023-9-13 19:26
标题: 求助：gromacs用gmx rdf计算9(r)和配位数
通过gmx rdf命令分别得到了锂离子周围氧原子的g(r)和配位数（-cn）曲线，在我之前的理解中g(r)曲线的高度大小粗略的可以对应于配位数的大小，但是在我计算的这个体系中却失效了,g(r）图我对比文献，文献里也是遵循g(r)曲线的高度大小粗略的可以对应于配位数的大小，我不知道是哪里有问题。

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作者
Author: sobereva 时间: 2023-9-13 23:21
g(r)跟配位数完全是两码事，做积分得到的配位数曲线才体现不同r内的配位数。g(r)仅体现r的薄壳层内的被统计粒子的相对密度而已。

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