计算化学公社

标题: 评价工作站3W左右的配置 [打印本页]

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-1 17:05
标题: 评价工作站3W左右的配置
本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-10-27 20:11 编辑

近日同学组里想购入一工作站，主要做不超过200原子的DFT，预算4W以下，其初步打算配置如下：

CPU ：E5-2690 v4*2；2.6G*14；若太贵，换为E5-2680 v4*2；2.4G*14
主板：ASUS Z10PE-D16 ~~ASUS Z10PA-D8(因尺寸太小、装不下散热器删除)~~
内存：金士顿 DDR4 2133 RECC 16G*8 或 32G*4
硬盘：2T SATA 企业级
散热器：九州风神大霜塔至尊版*2
电源：银欣750W ST75F-GS
光驱、机箱待配

想问下：

E5 CPU 的 v4 和 v3 有什么区别？例如 2690 v4 2.6G*14 的价格和 2690 v3 2.6G*12 的价格差不多，前者较新、还多两个核，但若根据Intel Ark的报价是几乎一样的，是不是 v4 有什么坑？

这个主板是否合适？另外一般的说，除了针数对之外、该靠什么参数选择主板？

这个主板似乎没有集显，是不是应该补一个显卡？什么显卡合适？

其他还有什么槽点？

作者
Author: 五十八 时间: 2016-9-1 17:23
V4制程先进，可以用2400的内存，相同型号有提高，买个gtx1080 （预算紧70也凑合）或者titanP 吧....硬盘买个pci的ssd加上一个nas 两个主板一样，主板...

作者
Author: 五十八 时间: 2016-9-1 17:27
2680感觉好鸡肋，用着2697v3 32 相同的体系，要比2667 v3 16的慢，但是好像用了if之后节点内32核和跨节点32核差不多
Job cpu time:    1 days 16 hours 23 minutes  6.8 seconds.
Job cpu time:    2 days  0 hours 16 minutes 36.8 seconds.
跨节点32
Job cpu time:    1 days 23 hours 29 minutes 42.7 seconds.

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-1 18:30

五十八发表于 2016-9-1 17:23
V4制程先进，可以用2400的内存，相同型号有提高，买个gtx1080 （预算紧70也凑合）或者titanP 吧....硬盘买 ...

需要的计算基本用不到显卡，是不是不需要那么好的显卡。
噫，不过这让我想起来 Gaussian 16有GPU加速，不知道值不值得买

作者
Author: 五十八 时间: 2016-9-1 19:56

liyuanhe211 发表于 2016-9-1 18:30
需要的计算基本用不到显卡，是不是不需要那么好的显卡。
噫，不过这让我想起来 Gaussian 16有GPU加速， ...

不需要显卡就装亮机卡呗，有个老师说用高斯的gpu效率不错（在会议上看的报告）但是不知道内存够不够，想用的话到时候再买一个吧...先买gt610.....自动斜眼....哦哦刚刚没看到电源，建议上1kw的最好，我现在用750w的还是单路就是双路了1070 有点吃力

作者
Author: shalene 时间: 2016-9-1 20:56
ASUS Z10PA-D8 自带集显

另ASUS Z10PA-D8太小，两个大霜塔不可能正常安装

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-1 21:06

shalene 发表于 2016-9-1 20:56
ASUS Z10PA-D8 自带集显

另ASUS Z10PA-D8太小，两个大霜塔不可能正常安装

啊这个意见很重要，十分感谢。
换成Z10PE-D16如何？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-1 22:50
v4主要是用了0.014微米的Broadwell-EP核心，v3是0.022微米的Haswell-EP。内存支持频率增加那么点基本可以忽略不计，这一代产品主要还是制程上的改进，使得同样功耗下性能得以进一步略微提升，但架构、同频同核性能基本没动。

用集显就完了，高斯的GPU加速的效果和普适性我并不怎么看好，估计也就是个实验性的东西，能真正发挥效果、买GPU划得来的场合寥寥。添加GPU到时候再说。而且像什么新出的GTX1080，双精度浮点几乎已经被阉割没了，几乎不可能用来GPU “加速”量化任务，而Titan又贵得飞起。

作者
Author: 一颗赛艇 时间: 2016-9-1 23:35
本帖最后由一颗赛艇于 2016-9-1 23:43 编辑

上超微的板子。不要用阿速死。阿速死还是太年轻，太简单，有时很天真

突然发现楼上社长的单位用错了……

作者
Author: 一颗赛艇 时间: 2016-9-1 23:36
本帖最后由一颗赛艇于 2016-9-1 23:40 编辑

像超微的X10DAi就不错。阴特儿的板子也可以。但这些板子机箱不好配

如果你们用的是VASP，8个内存通道要全用上

不用买显卡，主板上都有垃圾集显，如果你们当服务器用的话……

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-2 00:44

sobereva 发表于 2016-9-1 22:50
v4主要是用了0.014nm的Broadwell-EP核心，v3是0.022nm的Haswell-EP。内存支持频率增加那么点基本可以忽略不 ...

我明白了。也查了些其他资料、测评，似乎短期内GPU加速量化并没有说的那么美好。
谢谢Sob！

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-2 00:47

sobereva 发表于 2016-9-1 22:50
v4主要是用了0.014nm的Broadwell-EP核心，v3是0.022nm的Haswell-EP。内存支持频率增加那么点基本可以忽略不 ...

另外之前您一直建议用超微的主板，需不需要把 ASUS 这个 Z10PE-D16 换成超微的？换哪个合适些？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-2 06:06

一颗赛艇发表于 2016-9-1 23:35
上超微的板子。不要用阿速死。阿速死还是太年轻，太简单，有时很天真

突然发现楼上社长的单位用错了…… ...

打错了，是微米

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-2 06:07

liyuanhe211 发表于 2016-9-2 00:47
另外之前您一直建议用超微的主板，需不需要把 ASUS 这个 Z10PE-D16 换成超微的？换哪个合适些？

ASUS在服务器领域相对嫩一些，但换不换无妨

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-2 09:39

sobereva 发表于 2016-9-2 06:07
ASUS在服务器领域相对嫩一些，但换不换无妨

了解了。谢谢！

作者
Author: dreamyeye 时间: 2016-9-7 14:52

sobereva 发表于 2016-9-1 22:50
v4主要是用了0.014微米的Broadwell-EP核心，v3是0.022微米的Haswell-EP。内存支持频率增加那么点基本可以忽 ...

对于加速MD来说，最新的诸如GTX1060之类的，加速效果和前面的如GTX970、GTX770之类的相比也减弱了吗？

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-7 23:44

dreamyeye 发表于 2016-9-7 14:52
对于加速MD来说，最新的诸如GTX1060之类的，加速效果和前面的如GTX970、GTX770之类的相比也减弱了吗？

具体看程序。诸如gmx这样不要求GPU双精度能力的程序不会更弱只会更强

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-13 21:13

sobereva 发表于 2016-9-2 06:07
ASUS在服务器领域相对嫩一些，但换不换无妨

最后的配置和报价如下，不太了解是否合理。可否帮忙看一下是不是小贵，还有没有其他槽点？

CPU ：E5-2680 v4*2；2.4G*14
主板：ASUS Z10PE-D16
内存：金士顿 DDR4 2133 RECC 32G*4
硬盘：2T SATA 企业级
散热器：~~九州风神大霜塔至尊版*2~~ coolserver金钱豹2011长方形4U 5热管散热器
电源：~~银欣750W ST75F-GS~~ 长城巨龙 1000W GW-EPS1000DA 电源
机箱：至睿怒舰 DX7 机箱
光驱：华硕DVD-E818A9T

报价35000

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-14 07:17

liyuanhe211 发表于 2016-9-13 21:13
最后的配置和报价如下，不太了解是否合理。可否帮忙看一下是不是小贵，还有没有其他槽点？

CPU ：E5-2 ...

有一点油水，但还不算太坑，就当JS的赚头了

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-14 11:51

sobereva 发表于 2016-9-14 07:17
有一点油水，但还不算太坑，就当JS的赚头了

我明白了，十分感谢！

作者
Author: syjohn 时间: 2016-9-14 14:31
我想问个问题，如果单纯做动力学的话，主要应用maber和gromacs，是配楼上这种GPU服务器还是GPU家用电脑就可以呢？
一直比较困惑这个事情，
当然我不指价格方面，主要考虑性能方面

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-14 16:37
本帖最后由 liyuanhe211 于 2016-9-14 16:42 编辑

syjohn 发表于 2016-9-14 14:31
我想问个问题，如果单纯做动力学的话，主要应用maber和gromacs，是配楼上这种GPU服务器还是GPU家用电脑就可 ...

这不是GPU服务器。。。这里面根本没有GPU
当然是有钱就上大的、没钱就买PC。个人觉得带着GPU的话大概8000或以下就买PC；15000或以上就买服务器吧；这之间比较尴尬

作者
Author: lonemen 时间: 2016-10-28 17:26
参考一下，以后也装一个。

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)