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标题: MD模拟计算CO2溶解度，怎么获得CO2浓度曲线 [打印本页]

作者
Author: qjy111 时间: 2023-9-18 14:57
标题: MD模拟计算CO2溶解度，怎么获得CO2浓度曲线
请问一下想要通过MD模拟计算CO2溶解度，查看文献在一篇醇胺溶液吸收CO2文献里面发现了方法，但是他的CO2浓度曲线不是很理解，想问一下可以通过什么方法获得 (, 下载次数 Times of downloads: 43) (, 下载次数 Times of downloads: )

作者
Author: sobereva 时间: 2023-9-18 19:33
看文献里用的什么模型
MD跑完后CO2在体系不同截面的分布曲线可以用gmx density得到

作者
Author: qjy111 时间: 2023-9-22 11:00

sobereva 发表于 2023-9-18 19:33
看文献里用的什么模型
MD跑完后CO2在体系不同截面的分布曲线可以用gmx density得到

嗯嗯，谢谢sob老师，我看了相关数密度的帖子，理解了。论文里采用的是MS下的COMPASS力场，对象是醇胺溶液吸收CO2，如果我的对象是离子液体吸收CO2,离子液体力场采用gaff，CO2采用PME是否也同样可行了

作者
Author: sobereva 时间: 2023-9-23 05:24

qjy111 发表于 2023-9-22 11:00
嗯嗯，谢谢sob老师，我看了相关数密度的帖子，理解了。论文里采用的是MS下的COMPASS力场，对象是醇胺溶液 ...

PME指代不明。EPM2那是另一码事

作者
Author: leleyi 时间: 2025-6-16 10:49
你好相关论文可以分享一下吗最近刚入学后续可能会做相关工作

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