计算化学公社

标题: 求助氢键连接数量的统计 [打印本页]

作者
Author: 牛文文 时间: 2023-9-19 09:42
标题: 求助氢键连接数量的统计
12年的一篇Nature chemistry讨论磷酸的质子传导行为的文章中，提到磷酸的氢键连接数量，如下图
想请问下这种氢键连接数量有没有什么软件能够实现，或者如果是自己写代码分析的话，有没有比较简单的思路呢？
期待各位老师回答

作者
Author: sobereva 时间: 2023-9-20 03:42
利用measure hbonds，可以得到每两个磷酸之间形成的氢键情况。对每一对磷酸之间循环，可以构造一个磷酸之间氢键连接关系矩阵，然后再从里面搜索连接数
(, 下载次数 Times of downloads: 7)

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)