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标题: 使用cp2k对Cu团簇/Al2O3结构优化不收敛 [打印本页]

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卡卡西永恒    时间: 2023-9-19 20:48
标题: 使用cp2k对Cu团簇/Al2O3结构优化不收敛
本帖最后由 卡卡西永恒 于 2023-10-14 00:01 编辑

各位老师好,我先对扩胞后的Al2O3进行了结构优化,共四层,设置k点3,3,1,设置任务优化结构(晶胞尺寸不变),设置XY周期性,设置色散校正DFT-D3(BJ),固定下面两层原子,其他参数不变,运行后如图1所示,刚开始运行就终止了。后来我减小k点或降低基组使用SZV-MOLOPT-SR-GTH,也还是出现这种情况。

后来我就没有用k点,基组使用DZVP-MOLOPT-SR-GTH时,这时计算可以进行,但是震荡不收敛,然后我就把基组改为SZV-MOLOPT-SR-GTH,最后成功收敛。

现在我把Cu13团簇加入到了slab模型中,没有设置k点,设置任务优化结构(晶胞尺寸不变),设置XY周期性,固定下面两层原子,开启smearing,设置色散校正DFT-D3(BJ),基组使用SZV-MOLOPT-SR-GTH,但是计算也是刚开始运行就终止了。

我还要再降低基组吗,还是哪里设置的不合理


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sobereva    时间: 2023-9-20 03:03
运行方式或者编译有问题,我这里2023.1按下文编译和运行,用你的输入文件用popt版跑的好好的
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html

SZV-MOLOPT-SR-GTH太垃圾,没法用于发文章。震荡该怎么解决怎么解决,换更明显烂的基组根本不是办法

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卡卡西永恒    时间: 2023-9-20 10:56
sobereva 发表于 2023-9-20 03:03
运行方式或者编译有问题,我这里2023.1按下文编译和运行,用你的输入文件用popt版跑的好好的
CP2K第一性原 ...

sob老师,我是在ubuntu22.04里安装的cp2k.2023.1,根据别处的操作指南进行的编译,那我可以在这个基础上直接进行您说的这篇文章里的2.2和2.3节吗
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sobereva    时间: 2023-9-21 01:47
卡卡西永恒 发表于 2023-9-20 10:56
sob老师,我是在ubuntu22.04里安装的cp2k.2023.1,根据别处的操作指南进行的编译,那我可以在这个基础上 ...

语义不明
我博文里的情况是对于redhat系操作系统而言的,我拒绝使用Ubuntu。Ubuntu用户可在我博文基础上举一反三
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卡卡西永恒    时间: 2023-9-22 22:22
本帖最后由 卡卡西永恒 于 2023-9-22 22:23 编辑
sobereva 发表于 2023-9-21 01:47
语义不明
我博文里的情况是对于redhat系操作系统而言的,我拒绝使用Ubuntu。Ubuntu用户可在我博文基础上 ...

sob老师,我按照博文http://sobereva.com/586http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html)里的方法编译之后发现还是算不了,我觉得可能是我在Ubuntu里设置的内存太小了,于是我将内存从16G扩到32G,此时CPU和内存占用率也很高,但可以算下去了(用的还是上面那个输入文件),但是算的过程中SCF有时候收敛有时候不收敛,算了半天也没算完,但是您回复说您试了一下跑的好好的。并且我将没算完的restart文件导出cif文件,发现Cu13团簇有些变形。

我想请问是不是我提高内存增加核数能使SCF更容易收敛一些,我应该需要大概什么配置才能满足计算需求。还有就是我现在的设置有没有哪里不合理的地方需要改进一下

(我的具体操作是对Cu/γAl2O3的slab模型设置任务优化结构(晶胞尺寸不变),设置XY周期性,固定下面两层原子,开启smearing,设置色散校正DFT-D3(BJ),基组使用SZV-MOLOPT-SR-GTH,其他默认)




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sobereva    时间: 2023-9-23 05:38
卡卡西永恒 发表于 2023-9-22 22:22
sob老师,我按照博文http://sobereva.com/586(http://bbs.keinsci.com/thread- ...

计算资源的设置和SCF是否容易收敛没有直接关系

基组太烂,就算收敛了也没意义

SCF不收敛该怎么解决怎么解决
解决CP2K中SCF不收敛的方法
http://sobereva.com/665http://bbs.keinsci.com/thread-37196-1-1.html




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