计算化学公社

标题: 晶体中选取模型这样比较合理？ [打印本页]

作者
Author: 赵云跳槽 时间: 2016-9-2 21:02
标题: 晶体中选取模型这样比较合理？
本帖最后由赵云跳槽于 2016-9-2 21:06 编辑

请教大神，下面有个晶体怎样选取模型比较合理？最好有类似的晶体这样选取过（即文献说明）

对于人字型晶体（比如萘晶体），一般取中间五个分子
(, 下载次数 Times of downloads: 37)
对于砖砌型晶体（比如TIPS-并五苯晶体），一般取
(, 下载次数 Times of downloads: 45)

现在我有一个不知道啥型的晶体，请问我这样取简易模型比较合理呢？
(, 下载次数 Times of downloads: 35)
此分子是TCNQ晶体，cif文件已上传

作者
Author: chiweijie 时间: 2016-9-2 21:45
按照对称性选择就可以，一般上下，前后，左右，选择六个距离任意选定的中心分子距离最近的就可以。

作者
Author: 赵云跳槽 时间: 2016-9-2 22:23

chiweijie 发表于 2016-9-2 21:45
按照对称性选择就可以，一般上下，前后，左右，选择六个距离任意选定的中心分子距离最近的就可以。

根据对称原则，我尽量对取得模型进行简化，但还是感觉研究的模型过大
大神还有什么建议？
(, 下载次数 Times of downloads: 36)

作者
Author: chiweijie 时间: 2016-9-3 08:33
对比与大部分文献中的模型，你这个模型简直不能再小了。

作者
Author: 赵云跳槽 时间: 2016-9-3 09:29
但相对上面的计算模型来说，还是有点大，能不能再缩小点？

作者
Author: chiweijie 时间: 2016-9-3 09:36
不能

作者
Author: 赵云跳槽 时间: 2016-9-3 09:40
哦，好的，我先看看能否计算的动，谢谢老师

作者
Author: wei 时间: 2016-9-3 09:54
我觉得模型取多大取决于你研究什么问题，优化结构、算能量、算性质，这些都不同

作者
Author: 小范范1989 时间: 2016-9-3 11:26

赵云跳槽发表于 2016-9-3 09:40
哦，好的，我先看看能否计算的动，谢谢老师

用什么计算呢？高斯吗

作者
Author: 赵云跳槽 时间: 2016-9-3 15:41

小范范1989 发表于 2016-9-3 11:26
用什么计算呢？高斯吗

nwchem计算

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)