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标题: DPD排斥参数公式第一项那个25需要随着珠子映射比缩放吗? [打印本页]

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1121571266    时间: 2023-9-22 14:42
标题: DPD排斥参数公式第一项那个25需要随着珠子映射比缩放吗?
在Materials Studio的教程《Effects of surfactant on a lipid bilayer using DPD》(目录为Tutorials > Mesocite tutorials > Effects of surfactant on alipid bilayer using DPD)里提到:

也就是说排斥参数a和Flory-Huggins Chi parameter χ之间的关系第一项是常数25,但是这个25是将一个珠子代表一个水分子的时候的数值,但是这里选取的珠子的质量代表3个水分子的质量,因此这里的数值需要乘以3,大概就是78左右,正如教程里所说“Thedefault value in Mesocite (25) is based on the case where a bead represents onewater molecule (Groot and Warren, 1997).”。

然而,同样地,在Materials Studio的另一个教程《Calculating input parameters for a DPD simulation》(目录为Tutorials > Mesocite tutorials > Calculating input parametersfor a DPD simulation)中,一个珠子的质量为281.4 amu,然而这里却直接使用了这个公式:


这里明显一个珠子的质量并不是等于一个水分子的质量,却没有将第一项25进行scale,不知道是我的理解有问题还是怎么回事。希望老师不吝指教,万分感谢!!!






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