计算化学公社

标题: 求助 cp2k产生的molden文件电子密度拓扑分析 [打印本页]

作者
Author:
elpa    时间: 2023-9-23 09:46
标题: 求助 cp2k产生的molden文件电子密度拓扑分析
在链接里有两个molden文件A和B及其计算的inp文件,对两者利用multiwfn进行AIM分析。在计算时A是中性体系,B带-1电荷。A是可以正常找出所有(3,-3)点,但是B不能。求助是什么原因?
链接:https://pan.baidu.com/s/1pDK_f6oxXODQIIHs95StVw?pwd=1111
提取码:1111


作者
Author:
sobereva    时间: 2023-9-23 12:21
这是因为你的原子坐标偏离盒子范围太远。进入主功能0一看便知。CP2K合理的原子坐标应当都为正
解决方法是主功能300的子功能7里选22 Wrap all atoms outside the cell into the cell,从而把原子坐标都卷到盒子里。然后回到主菜单,照常做后续分析。对A体系最好也这么做





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