计算化学公社

标题: 如何构建一个类似正弦曲线状的曲率磷脂膜？ [打印本页]

作者
Author: Yaozhi_Yang 时间: 2023-9-24 22:12
标题: 如何构建一个类似正弦曲线状的曲率磷脂膜？
请问大家如何构建一个类似正弦曲线状的曲率磷脂膜呢？
目前尝试用力拉的方法，但是效果不太理想。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-9-25 01:45
诸如可以考虑自己写程序产生正弦曲线状的位置限制势的参考坐标，然后在弱限制势下跑MD
GROMACS目前还支持density-guided动力学，可以试图自己写程序产生期望的密度分布，使得MD过程中原子分布尽可能往自定义的分布里怼

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