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标题: 请教:水分子OH键与Z轴夹角的概率问题 [打印本页]

作者
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PHOENIXHMX    时间: 2023-9-25 16:00
标题: 请教:水分子OH键与Z轴夹角的概率问题
不知道大佬有没有做过这个,我用gromacs模拟水分子的运动体系,模拟后将水分子的运动轨迹文件提取出来,我用python编写计算两个角度,一个是水分子偶极与Z轴夹角,一个是水分子OH键与Z轴夹角。在统计OH键与Z轴夹角出现的概率时出现一个问题,角度在45°之后曲线出现曲折,找了很久一直没找到问题,偶极与Z轴夹角就没有这个问题,有没有大佬帮忙解答一下,感谢。

作者
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对抗路达摩    时间: 2023-9-29 10:30
首先你的采样不平滑,把模拟时间拉长一点,或者把输出轨迹的间隔减小一点,看是否还有一样的问题。




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