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标题: VASP提交命令用哪个好 [打印本页]

作者
Author: dingniu2 时间: 2023-9-26 13:11
标题: VASP提交命令用哪个好
VASP提交任务的命令有如下两个：
（1）nohup mpirun -np 32 vasp_std 1> vasp.out 2> vasp.err&
（2）nohup mpirun -np 32 vasp_std > vasp.out 2>&1 &
请问：
1. 第（1）种方式的输出和错误分别写在2个文件中，第（2）种方式是不是就是将第（1）种方式产生的两个文件合并为一个，内容上无任何差别？
2. 输出的重要信息都在OUTCAR中，产生的vasp.out 文件是不是没有什么用处？什么情况下会用到vasp.out中的信息？
3. 除了以上（2）之外，是否还有其它流行的提交VASP任务的命令？

作者
Author: abin 时间: 2023-9-26 13:47
srun -c 1 -n 64 -N 8 vasp_std

作者
Author: 乐平 时间: 2023-9-26 15:25
首先，请说明一下你用的是什么作业管理系统吧。

作者
Author: 乐平 时间: 2023-9-26 15:38

abin 发表于 2023-9-26 13:47
srun -c 1 -n 64 -N 8 vasp_std

这个回答有点“以暴制暴” 的感觉

提问者没说自己用的是什么作业管理系统，回答者也不追问，直接给 slurm 的命令。
万一对方用的是 PBS 呢？
甚至根本没有作业管理系统呢（从 nohup 命令加 & 结尾来猜测的）

作者
Author: abin 时间: 2023-9-26 18:08
无论是单机，单用户，还是单机多用户，
保证最佳效率的道路，
只有采用调度器一条路……

如果用pbs，srun必定报错……翻一下手册，当然立即能修正过来的……

与其使用nohup，难道screen 直接前台不香吗？
我随便点X关掉都没影响……

作者
Author: dingniu2 时间: 2023-9-26 19:01

乐平发表于 2023-9-26 15:25
首先，请说明一下你用的是什么作业管理系统吧。

感谢回复，这个服务器自己用，没有作业管理系统。请问产生的vasp.out有什么用处？谢谢！

作者
Author: 乐平 时间: 2023-9-27 10:20
本帖最后由乐平于 2023-9-27 10:30 编辑

dingniu2 发表于 2023-9-26 19:01
感谢回复，这个服务器自己用，没有作业管理系统。请问产生的vasp.out有什么用处？谢谢！

果然猜对了，没有作业管理系统……

我理解的产生的 vasp.out 相当于日志文件，记录计算过程中的信息，看起来和 OUTCAR 里的差不多，但是简略一些。

作者
Author: dingniu2 时间: 2023-9-27 12:53

乐平发表于 2023-9-27 10:20
果然猜对了，没有作业管理系统……

我理解的产生的 vasp.out 相当于日志文件，记录计算过程中的信息 ...

谢谢，也就是说vasp.out有的信息，OUTCAR都有，看来这个vasp.out没有什么特别的价值。

作者
Author: 含光君 时间: 2023-9-27 13:14

dingniu2 发表于 2023-9-27 12:53
谢谢，也就是说vasp.out有的信息，OUTCAR都有，看来这个vasp.out没有什么特别的价值。

out里面的信息比OSZICAR多一点，比OUTCAR少，直接看out文件还是挺方便掌握任务的大致情况的。

作者
Author: dingniu2 时间: 2023-9-27 13:20

含光君发表于 2023-9-27 13:14
out里面的信息比OSZICAR多一点，比OUTCAR少，直接看out文件还是挺方便掌握任务的大致情况的。

感谢回复，请问out里面是否有一些特殊的信息，而在OUTCAR里没有的吗？不太理解既然有OUTCAR了，OUTCAR也是实时更新，为什么VASP还要弄一个这个屏幕输出信息？

作者
Author: 含光君 时间: 2023-9-27 19:12

dingniu2 发表于 2023-9-27 13:20
感谢回复，请问out里面是否有一些特殊的信息，而在OUTCAR里没有的吗？不太理解既然有OUTCAR了，OUTCAR也 ...

OUTCAR里会包含out文件里信息。

我们检查收敛到什么情况时，一般会去看OSZICAR，那里面每个电子步就输出一行。如果是OUTCAR，每个电子步会输出一堆，看起来就不那么直观了。
此外如果优化收敛了。OSZICAR最后是没有任何提示的。out文件会和OUTCAR一样输出“reached required accuracy”，你就知道已经算完了。

所以我算的时候喜欢看out文件监控任务，当然输出什么文件、看哪个文件全凭个人习惯。顺便提一句，Peter Larsson写的一个脚本也很适合监控任务，见网址https://www.nsc.liu.se/~pla/software/grad2.py

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