计算化学公社

标题: 求助:有机晶体进行NMR屏蔽常数计算 出错 [打印本页]

作者
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lwang2016    时间: 2023-9-27 09:05
标题: 求助:有机晶体进行NMR屏蔽常数计算 出错
本帖最后由 lwang2016 于 2023-9-27 09:05 编辑

各位老师,大家好。

我对一个有机晶体进行了
1.几何优化(DZVP-MOLOPT-SR-GTH、PBEsol、K取1 5 2)
2.NMR屏蔽常数计算(pcSseg-1、REVTPSS)

发现第二步NMR计算出错(出错提示为“The matrix diagonalization with dsyev failed”),
由于最近开始学习CP2K软件的使用,肯请大家指点是哪里设置出问题了。

谢谢

作者
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sobereva    时间: 2023-9-27 09:21
把2nmr.inp载入Multiwfn进主功能0一看就知道明显不合理,绝大部分晶胞都是空着的,完全没有任何意义,根本不是有机晶体
作者
Author:
lwang2016    时间: 2023-9-27 09:34
sobereva 发表于 2023-9-27 09:21
把2nmr.inp载入Multiwfn进主功能0一看就知道明显不合理,绝大部分晶胞都是空着的,完全没有任何意义,根本 ...

多谢卢老师,

multiwfn软件打开2nmr.inp看着是不正常。

不过我打开几何优化后的结构是正常的。

请问是NMR计算的输入文件出错了么。
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-9-27 10:51
lwang2016 发表于 2023-9-27 09:34
多谢卢老师,

multiwfn软件打开2nmr.inp看着是不正常。

产生NMR输入文件的过程没弄对
作者
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lwang2016    时间: 2023-9-27 12:14
sobereva 发表于 2023-9-27 10:51
产生NMR输入文件的过程没弄对

卢老师 好。

按照您的教程ppt,在使用multiwfn进行NMR输入文件制作时 去除了周期性,就出现了晶胞尺寸变大,晶胞未填满的现象。

另外试了一下保留周期性,晶胞就未出现不填满的现象。

请问老师是否要去掉周期性。
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-9-28 05:47
lwang2016 发表于 2023-9-27 12:14
卢老师 好。

按照您的教程ppt,在使用multiwfn进行NMR输入文件制作时 去除了周期性,就出现了晶胞尺寸 ...

你算的是晶体,去除周期性作甚,此时算的根本什么都不是




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