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标题: 求助“CO2体系中添加异质颗粒,二者力场采用不同的势,应当如何处理呢?” [打印本页]

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LWM    时间: 2023-9-27 11:19
标题: 求助“CO2体系中添加异质颗粒,二者力场采用不同的势,应当如何处理呢?”
本帖最后由 LWM 于 2023-9-27 11:22 编辑

各位前辈,我打算利用gromacs模拟CO2在异质颗粒(Fe2O3)表面的凝结,CO2采用EPM2力场,但是CO2力场采用的是LJ势,而Fe2O3常采用的是Coulombic-Buckingham势,这个应当如何处理呢?同时,我应当如何去构建Fe2O3的pdb呢?

作者
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sobereva    时间: 2023-9-28 05:54
整个模拟描述范德华作用,要么用LJ,要么Buckingham,没法互用,除非折腾一下用列表势,或者把其中之一的势函数用另一种势函数重新拟合一下

基于晶体的cif文件,用GaussView等可以切表面、挖团簇之类
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LWM    时间: 2023-9-28 09:10
sobereva 发表于 2023-9-28 05:54
整个模拟描述范德华作用,要么用LJ,要么Buckingham,没法互用,除非折腾一下用列表势,或者把其中之一的势 ...

好的,感谢sob老师




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