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标题: 关于ADMP计算中Random Number Generator Seed对结果的影响 [打印本页]

作者
Author: 高章磊 时间: 2023-9-27 12:30
标题: 关于ADMP计算中Random Number Generator Seed对结果的影响
本帖最后由高章磊于 2023-10-2 10:46 编辑

最近一段时间一直在用ADMP算一个分子的震动，分子模型如图所示：（氢原子这里省略了，没有显示）
主要是研究上下两个五元环在进行ADMP计算中的运动情况。
之前只关注了NKE对于计算结果的影响，前段时间仔细看了一下out文件，发现Random Number Generator Seed也会对计算结果产生很大的影响，之前的计算这个参数都是默认的398465，通过IOp(1/44=x)的方式可以在输入文件中修改这个参数为x。这个参数我查了一下能设置的范围很广，很多回答中也都说这个参数是完全随机产生新的初始能量分配，我想问一下真的是完全随机的吗？因为在其他条件相同的情况下，不同的Random Number Generator Seed会产生完全不同的计算结果。而我们和实验组合作，始终没办法得到合适的计算数据，所以很困扰。请问有人指点一下吗？感谢万分。

作者
Author: 高章磊 时间: 2023-9-27 12:32
本帖最后由高章磊于 2023-10-2 10:47 编辑

前面图片好像上传有问题，重新上传一下。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-9-27 17:47
仔细看http://sobereva.com/88
正确的做法是随便取很多个不同的Random Number Generator Seed，然后统计有多少条轨迹得到想要的结果，多少条没有得到。一般而言不需要所有轨迹都跑出想要的结果，对于某些研究目的（例如研究实验上唯一一个能够观测到的反应途径，但实验灵敏度不高，不排除有少许副反应），只要绝大部分轨迹的结果满足预期就行了；有的情况下（例如研究主反应途径）只要过半满足预期就行了；有的情况下（例如探究一个反应是否能发生）只要有一条满足预期就行了。只取一个Random Number Generator Seed做计算在绝大多数情况下是不行的，哪怕这个Random Number Generator Seed是默认的、你之前用过的或前人用过的，也不行

作者
Author: sobereva 时间: 2023-9-28 05:55

高章磊发表于 2023-9-27 12:32
前面图片好像上传有问题，重新上传一下。

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员必读贴里明确说了。

作者
Author: 高章磊 时间: 2023-9-28 12:57

sobereva 发表于 2023-9-28 05:55
有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充，这点在置顶的新社员 ...

了解了，不好意思啊，没注意，刚改过原帖了。

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