计算化学公社

标题: 如何刚性扫描势能面 [打印本页]

作者
Author: 西瓜太郎 时间: 2016-9-4 21:54
标题: 如何刚性扫描势能面
前几天看了gview的教学视频，视频中讲通过Redundant coord editor设定参数就可以扫描势能面，但是扫描后分子构型却发生了变化，所以我想刚性扫描。可是选择calculate>Job type>scan/Rigid之后却出现了一句话，scan coordinate must be added manually in input file!接下来该怎么操作呢？
本人刚接触计算化学，好多基础性问题不甚了解，请大神帮忙解答一下，不胜感激！

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-4 22:24
非要GV的话自己在Calculation-Add. Inp.里按照下面网页中的格式声明扫描的变量：
http://www.gaussian.com/g_tech/g_ur/k_scan.htm

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-4 22:26
(, 下载次数 Times of downloads: 54)
(, 下载次数 Times of downloads: 51)

作者
Author: xujian 时间: 2016-9-5 08:44
请问老师，刚性扫描和柔性扫描有何差别啊，分别适用在于何种情况呢？

作者
Author: 灰飞的旋律 时间: 2016-9-5 11:05

sobereva 发表于 2016-9-4 22:26

请问像我这种原子数很多，而我想要做键长扫描的两个原子其中一个的序号无法改变，怎么办？如图

(, 下载次数 Times of downloads: 31)

我想扫描67号原子向68原子靠近时的势能面，可是我把18改成68后，他又会恢复为18，那我这输入文件的坐标可咋弄？
我是想在原子列表编辑器中修改原子序号，输出内坐标坐标系的文本，再粘贴到输入文件中。

作者
Author: 西瓜太郎 时间: 2016-9-5 15:34

xujian 发表于 2016-9-5 08:44
请问老师，刚性扫描和柔性扫描有何差别啊，分别适用在于何种情况呢？

刚性扫描是只改变指定坐标，其它分子坐标都不随之变化。
柔性扫描是将指定变化的坐标按要求赋值以后，再对其它分子坐标进行优化使之满足一个最小值（相当于通过鞍点的最低底线）。

作者
Author: xujian 时间: 2016-9-5 15:35
谢谢！

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-6 00:04

灰飞的旋律发表于 2016-9-5 11:05
请问像我这种原子数很多，而我想要做键长扫描的两个原子其中一个的序号无法改变，怎么办？如图

若是柔性扫描用不着去改序号，直接定义扫哪两个原子间距离就完了，方便得多，结果也更有实际意义

欢迎光临计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/)