计算化学公社

标题: 安装CP2K前安装MKL数学库时出现错误怎么解决? [打印本页]

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Wenchuan    时间: 2023-10-3 19:39
标题: 安装CP2K前安装MKL数学库时出现错误怎么解决?
安装CP2K前安装MKL数学库时,运行dnf install intel-mkl命令时,出现Error: Failed to download metadata for repo 'intel-mkl-repo': repomd.xml GPG signature verification error: Bad GPG signature,是什么问题,怎么解决呢?

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zjxitcc    时间: 2023-10-3 20:33
若在集群上,往往管理员已事先安装好(运行module avai查看是否有安装好的Intel MKL可直接加载),甚至可直接使用(运行echo $MKLROOT查看当前机器是否已有Intel MKL生效)。若无直接可用版本,也可下载离线安装包自行安装,资源见http://bbs.keinsci.com/thread-11614-1-1.html
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sobereva    时间: 2023-10-3 21:43
一般情况根本没必要安MKL,下文说了
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/586http://bbs.keinsci.com/thread-21608-1-1.html


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Wenchuan    时间: 2023-10-3 22:20
sobereva 发表于 2023-10-3 21:43
一般情况根本没必要安MKL,下文说了
CP2K第一性原理程序在CentOS中的简易安装方法
http://sobereva.com/5 ...

在CP2K安装时也有错误,出现ERROR: (./scripts/install_gcc.sh) cannot find gfortran后,运行dnf install gcc-gfortran装gfortran编译器时,出现Error: Failed to download metadata for repo 'intel-mkl-repo': repomd.xml GPG signature verification error: Bad GPG signature。(以前未出现该问题,今天安装刚出现。)通过下载安装包gcc-10.1.0的方式安装编译器后,在安装Installing OpenMPI时出现:
configure: error: Could not run a simple Fortran program.  Aborting.
make: *** No targets specified and no makefile found.  Stop.
make: *** No rule to make target 'install'.  Stop.
请问这有解决方法吗?
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abin    时间: 2023-10-4 09:50
本帖最后由 abin 于 2023-10-4 09:52 编辑

签名失效,是某个repo的加密检验失效

可以在repo中,修改
gpgcheck=0
大概如此……

或者使用OneAPI

或者使用我提供的下载即用版本……
https://gitee.com/hpc4you/apps

不过,我相信自己可以搞定



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乐平    时间: 2023-10-4 12:14
Wenchuan 发表于 2023-10-3 22:20
在CP2K安装时也有错误,出现ERROR: (./scripts/install_gcc.sh) cannot find gfortran后,运行dnf instal ...

2 楼已经问过一次了,这里我再问一遍。你是在超算集群里安装? 还是在自己的电脑里安装?

如果是在超算集群,那么这些 MKL, gcc, gfortran 往往都已经安装好了,你只需要调用即可。

如果是在自己的电脑里安装,可能需要更换一下源。可以在网上搜一下“更换阿里源”,“更换华为源”之类的,然后再安装。
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Wenchuan    时间: 2023-10-4 21:30
感谢各位的回答,下载intel-mkl.repo文件,https://yum.repos.intel.com/mkl/setup/intel-mkl.repo,将repo_gpgcheck=1改为repo_gpgcheck=0,运行dnf config-manager --add-repo intel-mkl.repo即可解决问题。




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