计算化学公社

标题: ORCA能否将两个片段(金属离子和配体)的gbw文件合成一个新的gbw文件? [打印本页]

作者
Author:
CLJJ    时间: 2023-10-10 20:34
标题: ORCA能否将两个片段(金属离子和配体)的gbw文件合成一个新的gbw文件?
各位老师好,我在分析锕系金属离子(使用全电子基组)与有机配体形成的配合物的电子构型的过程中,需要将配合物分成两个片段,一个片段是金属离子,一个片段是有机配体。基于Gaussian优化的配合物结构,将金属离子以及有机配体的坐标提取出来,用orca对两个片段分别进行单点能计算,之后对金属离子的片段调整轨道占据初猜方式,得到两个波函数gbw文件。

请问能否在orca中将这两个波函数文件直接组合在一起产生一个新的波函数gbw文件呢?使得其可以用于后续的计算。

(如果将两个gbw文件分别转为molden文件,再转为fchk文件,在Multiwfn软件中可以将两个fchk文件合在一起生成一个新的fchk文件,再将新的fchk文件转成mkl文件,再在orca中转成gbw文件,再用orca计算可以实现上述目的,但是由于我计算的是锕系金属离子,电子构型比较复杂,所以担心如此繁琐的过程会产生一些问题。)





作者
Author:
wzkchem5    时间: 2023-10-10 21:14
可以,orca有一个工具叫做orca_mergefrag,在orca手册里搜一下就能找到用法。
此外如果最终目的只是算配合物,不是一定需要两个片段各自的波函数的话,可以改用flipspin等关键字一步得到想要的配合物波函数,而未必需要用片段初猜方法
作者
Author:
CLJJ    时间: 2023-10-10 21:23
本帖最后由 CLJJ 于 2023-10-10 23:11 编辑
wzkchem5 发表于 2023-10-10 21:14
可以,orca有一个工具叫做orca_mergefrag,在orca手册里搜一下就能找到用法。
此外如果最终目的只是算配合 ...

谢谢老师的回复,我去阅读了orca手册的相关部分,发现orca_mergefrag关键词好像不适用于将一个开壳层片段与一个闭壳层片段进行组合,但是我的金属离子是开壳层,配体是闭壳层;并且我想构造的初猜就是将金属离子的一个5f占据轨道与一个6d未占据轨道进行调换,即将金属离子的外层价电子构型从5f5变成5f46d1,配体的电子构型保持不变,这与使用对称性破缺关键词Flipspin的情况不太相同,请问老师现在这种情况该如何解决呀?
作者
Author:
sobereva    时间: 2023-10-11 01:09
倘若支持把两个开壳层的波函数合并,把闭壳层的那个当开壳层计算就完了

靠Multiwfn完全可以实现你的目的。交换两个轨道在主功能6里用29 Exchange information of two orbitals。主功能6里37 Split spatial orbitals as alpha and beta spin orbitals还可以将原本的闭壳层波函数转换成alpha和beta相同的开壳层波函数。
作者
Author:
CLJJ    时间: 2023-10-11 10:18
sobereva 发表于 2023-10-11 01:09
倘若支持把两个开壳层的波函数合并,把闭壳层的那个当开壳层计算就完了

靠Multiwfn完全可以实现你的目的 ...

好的,谢谢老师的回复。




欢迎光临 计算化学公社 (http://bbs.keinsci.com/) Powered by Discuz! X3.3