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标题: 使用AOCC和AOCL编译vasp出错请教 [打印本页]

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Author: 1030266769 时间: 2023-10-12 15:38
标题: 使用AOCC和AOCL编译vasp出错请教
课题组新来了一台服务器EYPC3代（处理器是7B13），系统是ubuntu
这两天在网上找了三种方法编译vasp6.3.2但一直都失败了，心累

1.oneapi2023
2.aocc和aocl
3.spack

由于在网上看很多aocc和aocl编译vasp教程比较多，所以发这个帖子主要请教大佬aocc和aocl编译vasp问题，以下是编译步骤

1.官网下载aocc、aocl、这两个是3.2版本，openmpi4.1.4，这几个软件编译在opt/AMD的目录下

编译aocc

tar -xvf aocc-compiler-3.2.0.tar
cd aocc-compiler-3.2.0
./install.sh
source ../setenv_AOCC.sh

编译aocl

tar -zxvf aocl-linux-aocc-3.2.0.tar.gz
cd aocl-linux-aocc-3.2.0
./install.sh -t /opt/AMD

编译openmpi

tar -zxvf openmpi-4.1.4.tar.gz
cd openmpi-4.1.4
CC=clang CXX=clang++ FC=flang ./configure
make -j4
make install

将openmpi增加到环境变量

MPI_HOME=/usr/localexport PATH=${MPI_HOME}/bin:$PATHexport LD_LIBRARY_PATH=${MPI_HOME}/lib:$LD_LIBRARY_PATHexport MANPATH=${MPI_HOME}/share/man:$MANPATH

2.编译vasp
将安装包解压后，修改makefile.include，已贴上
make
出现错误如图

作者
Author: 1030266769 时间: 2023-10-12 15:42
AMD服务器使用aocc和aocl编译vasp出错求指教

作者
Author: abin 时间: 2023-10-12 16:29
本帖最后由 abin 于 2023-10-12 16:31 编辑

https://pan.baidu.com/s/1r7PduYXqjn3kpS-ie0H8NQ?pwd=aknc
这里有.
我也不晓得我怎么搞成功的.

比较玄幻.

如果使用spack, 大致流程是:

spack load aocc
spack install vasp +scalapack +openmp +fftlib %aocc ^amdfftw ^amdblis threads=openmp ^amdlibflame ^amdscalapack ^openmpi fabrics=auto

复制代码

Ref: https://www.amd.com/zh-cn/develo ... ons/spack/vasp.html

bing.com for “AMD vasp spack” 就有结果呀.

当然了, 你是否搞得定spack是另外一回事情.

作者
Author: 1030266769 时间: 2023-10-12 16:35

abin 发表于 2023-10-12 16:29
https://pan.baidu.com/s/1r7PduYXqjn3kpS-ie0H8NQ?pwd=aknc
这里有.
我也不晓得我怎么搞成功的.

这里面是？有教程嘛，能不能指点一下这个怎么用

作者
Author: biogon 时间: 2023-10-12 16:57
你明明用的是gnu编译器，哪用aocc了

作者
Author: abin 时间: 2023-10-12 18:18

1030266769 发表于 2023-10-12 16:35
这里面是？有教程嘛，能不能指点一下这个怎么用

教程，上面写了呀！

我提供的百度分享，如何用，里面有文字说明呀！
不想看文字，也有图片说明呀……
阅读一下就晓得了

作者
Author: 1030266769 时间: 2023-10-12 20:40

biogon 发表于 2023-10-12 16:57
你明明用的是gnu编译器，哪用aocc了

是我下载错了嘛，安装包不是aocc-compiler3-.2.0嘛，我的makefile是在您的基础上改的

作者
Author: 1030266769 时间: 2023-10-12 20:46

abin 发表于 2023-10-12 18:18
教程，上面写了呀！

我提供的百度分享，如何用，里面有文字说明呀！

好的谢谢，看到了

作者
Author: 1030266769 时间: 2023-10-12 21:09

biogon 发表于 2023-10-12 16:57
你明明用的是gnu编译器，哪用aocc了

我也挺好奇，configure openmpi的时候加了CC=clang CXX=clang++ FC=flang，make完的时候mpicc后还是显示的gcc，这是为什么

作者
Author: biogon 时间: 2023-10-13 12:01

1030266769 发表于 2023-10-12 20:40
是我下载错了嘛，安装包不是aocc-compiler3-.2.0嘛，我的makefile是在您的基础上改的

你仔细看报错，报错都是gfortran不是flang，不知道你怎么改的，编译器也没设环境变量吧

作者
Author: 短耳鸮 时间: 2024-1-5 16:52
我也是两种方法都遇到报错，使用spack是找不到vasp@6.4.2，使用aocc和aocl是在编译openmpi的时候出现 C and C++ compilers are not link compatible. Can not continue。太折磨了，编译这个vasp

作者
Author: 短耳鸮 时间: 2024-1-5 17:18

abin 发表于 2023-10-12 16:29
https://pan.baidu.com/s/1r7PduYXqjn3kpS-ie0H8NQ?pwd=aknc
这里有.
我也不晓得我怎么搞成功的.

请问测试过这个吗，都一样能用吗

作者
Author: abin 时间: 2024-1-5 21:46

短耳鸮发表于 2024-1-5 17:18
请问测试过这个吗，都一样能用吗

你要测试什么？
又在问，什么能不能用？

作者
Author: yurainingak 时间: 2024-1-21 11:28
本帖最后由 yurainingak 于 2024-1-22 11:48 编辑

我也是遇到这个问题，按照论坛里面的步骤编译的，总是出现关于gfortran的错误：
gfortran: error: unrecognized command line option ‘-fno-fortran-main’; did you mean ‘-fcx-fortran-rules’?
/work/home/acwstluj3z/soft/openmpi4.1.4-amd/bin/mpif90 -ffree-form -ffree-line-length-none -w -fno-fortran-main -Mbackslash -march=native -O2 -I/work/home/acwstluj3z/soft/AMD/4.1.0/aocc/include -c mpi_shmem.f90
gfortran: error: unrecognized command line option ‘-fno-fortran-main’; did you mean ‘-fcx-fortran-rules’?
gfortran: error: unrecognized command line option ‘-Mbackslash’; did you mean ‘-fbackslash’?

环境变量AOCC和AOCL以及openmpi都设置好了.
vasp官方论坛里也有类似的提问：

https://www.vasp.at/forum/viewtopic.php?t=18794

后来还是结合上面vasp官方论坛里面的信息解决了：不要加载系统自带的mpi，一般可以用module list看当前加载了哪些；用module unload卸载掉；
只有用mpif90 -v 命令得到的信息里面提到mpi是用AMD aocc编译的才可以。

作者
Author: ginlpein 时间: 2024-5-18 00:17
本帖最后由 ginlpein 于 2024-5-18 00:32 编辑

yurainingak 发表于 2024-1-21 11:28
我也是遇到这个问题，按照论坛里面的步骤编译的，总是出现关于gfortran的错误：
gfortran: error: unrecog ...

您好,请问您能贴一下您安装完的机子使用“mpif90 -show”和“mpif90 -v”的输出情况吗？
我是在Rocky 9.3的白板系统上安的，应该不存在自带的mpi系统，甚至没有module, gcc , gfortran。（甚至gcc和gfortran我是在openmpi编译过程中提示需要我才yum安装的）（因为没有module所以也没法module list和module unload）

我的现状和你之前的问题相近，环境变量配置完成以后，“which mpif90”和论坛链接里提到的“mpif90 -show”的输出信息都是成功指向aocc编译好的openmpi ,但是唯独"mpif90 -v“输出指向了gfortran的安装位置，不知道这该咋调整？希望您不吝赐教

$ which mpif90
/opt/openmpi-5.0.3/bin/mpif90
$ mpif90 -show
gfortran -I/opt/openmpi-5.0.3/include -I/opt/openmpi-5.0.3/lib -L/opt/openmpi-5.0.3/lib -Wl,-rpath -Wl,/opt/openmpi-5.0.3/lib -Wl,--enable-new-dtags -lmpi_usempif08 -lmpi_usempi_ignore_tkr -lmpi_mpifh -lmpi
$ mpif90 -v
Using built-in specs.
COLLECT_GCC=/opt/rh/gcc-toolset-12/root/usr/bin/gfortran
COLLECT_LTO_WRAPPER=/opt/rh/gcc-toolset-12/root/usr/libexec/gcc/x86_64-redhat-linux/12/lto-wrapper
OFFLOAD_TARGET_NAMES=nvptx-none
OFFLOAD_TARGET_DEFAULT=1
Target: x86_64-redhat-linux
Configured with: ../configure --enable-bootstrap --enable-languages=c,c++,fortran,lto --prefix=/opt/rh/gcc-toolset-12/root/usr --mandir=/opt/rh/gcc-toolset-12/root/usr/share/man --infodir=/opt/rh/gcc-toolset-12/root/usr/share/info --with-bugurl=https://bugs.rockylinux.org/ --enable-shared --enable-threads=posix --enable-checking=release --enable-multilib --with-system-zlib --enable-__cxa_atexit --disable-libunwind-exceptions --enable-gnu-unique-object --enable-linker-build-id --with-gcc-major-version-only --enable-libstdcxx-backtrace --with-linker-hash-style=gnu --enable-plugin --enable-initfini-array --with-isl=/builddir/build/BUILD/gcc-12.2.1-20221121/obj-x86_64-redhat-linux/isl-install --enable-offload-targets=nvptx-none --without-cuda-driver --enable-offload-defaulted --enable-gnu-indirect-function --enable-cet --with-tune=generic --with-arch_64=x86-64-v2 --with-arch_32=x86-64 --build=x86_64-redhat-linux --with-build-config=bootstrap-lto --enable-link-serialization=1
Thread model: posix
Supported LTO compression algorithms: zlib zstd
gcc version 12.2.1 20221121 (Red Hat 12.2.1-7) (GCC)

复制代码

上面是我探查mpif90版本的三个命令的输出信息，感觉指向后续不一样？不知道这环境变量设置算不算生效？

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