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标题: 求助：amber优化体系时，运行density.in这一步的作用是什么？ [打印本页]

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Author: 灵芝5 时间: 2023-10-15 11:07
标题: 求助：amber优化体系时，运行density.in这一步的作用是什么？
你好，

我是一个amber的初学者，很多方面不太懂。

我在用amber模拟一个膜蛋白-小分子-POPC的复合物体系。在网上找了一个模拟水溶液蛋白的帖子，里面给出的优化步骤有density一步。

但是我不太理解这一步的作用是什么？不知道用于我的体系是否合理？

density.in文件内容如下。

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