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标题: 一篇文献的分子动力学数据结果的分析的问题 [打印本页]

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Author: iamjjLin 时间: 2023-10-16 16:35
标题: 一篇文献的分子动力学数据结果的分析的问题
各位老师您好！
我最近在对一篇文献进行数据模拟时遇到了一些问题，主要是对分子动力学数据的分析上，问题如下：
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如图：这篇文献使用分子动力学对水平偶极比进行模拟计算。它用256个主体分子作为基底，一个客体分子在基底上方模拟沉积和吸附。
动力学时长为6ns，步长为1ps，每6ps记录一次数据，一个客体分子共有1000组数据。
上图横坐标为时间；黑线对应左轴，左轴为客体分子的跃迁偶极矩与整体体系坐标轴z轴的夹角φ，再将夹角做sin的平方，得到各个时间点的Θ，Θ=（sinφ）^2,整个轴的范围为0~1.0；
红线对应右轴，右轴为客体分子的局部坐标轴z轴与整体体系坐标轴z轴的夹角，范围为0~180度。
右下角的小框里第一行表示这图的序号，第二行是作者对黑线数据整理得到的综合Θ值。
我的问题是：这个综合Θ值是如何得出的？将黑线进行拟合还是说将黑线上所有数据取平均值？亦或是有什么专门的计算方法？
文献：DOI: 10.1038/s41467-017-00804-0

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