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标题: 想用初始晶胞扩胞Ca10（PO4）6（OH）2晶体 [打印本页]

作者
Author: 分子模拟糕手 时间: 2023-10-17 12:11
标题: 想用初始晶胞扩胞Ca10（PO4）6（OH）2晶体
我在网上下了羟基磷灰石晶胞的初始晶胞的cif，用gaussianview打开后转成pdb文件，但是发现有4个羟基，这是为什么啊，下面是cif文件里面的坐标
_atom_site_aniso_label
_atom_site_aniso_U_11
_atom_site_aniso_U_22
_atom_site_aniso_U_33
_atom_site_aniso_U_12
_atom_site_aniso_U_13
_atom_site_aniso_U_23
CaI 0.01046 0.01046 0.00432 0.00523 0.00000 0.00000
CaII 0.00709 0.00776 0.00671 0.00337 0.00000 0.00000
P 0.00641 0.00574 0.00599 0.00337 0.00000 0.00000
OI 0.01316 0.01012 0.01295 0.00911 0.00000 0.00000
OII 0.00675 0.00877 0.02301 0.00304 0.00000 0.00000
OIII 0.03104 0.01417 0.01175 0.01518 -0.01166 -0.00768
Oh 0.00844 0.00844 0.02445 0.00422 0.00000 0.00000
H 0.04353 0.04353 0.02493 0.02177 0.00000 0.00000

作者
Author: sobereva 时间: 2023-10-18 03:47
那叫GaussView
把cif文件上传，并且修改帖子标题让标题内容和帖子内容准确对应。
当前问题和GROMACS没有丝毫直接联系，别乱选GROMACS分类。这次给你改了，以后注意。

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