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标题: 牵引力模拟，在3000的牵引力下顺利牵引，稍微降低一点牵引分子就不动了怎么解决？ [打印本页]

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Author: whuuan 时间: 2023-10-19 15:30
标题: 牵引力模拟，在3000的牵引力下顺利牵引，稍微降低一点牵引分子就不动了怎么解决？
求助一下大家，我使用恒力对部分指定的水分子（20-30个）做了一个牵引，牵引坐标另一端是选用了部分冻结的水分子，然后发现牵引力设置在3000及以上的时候都能够顺利牵引，且在50ps左右的时间就能够到达理想位置，但降到2500以下的时候，想要牵引的水分子就不动了，不论模拟多长时间都不会移动。整个模拟除了牵引力调整以外别的参数都没变，这是什么原因啊？

有尝试过减小模拟步长和提高轨迹写入频率，但没有明显作用。

后来我又尝试在3000kJ/mol/nm2的牵引力下模拟进行了500ps，发现在50ps左右就能到达理想位置后就把模拟时长降至50ps，其它参数都没有变化，重新进行了一次模拟，然后发现牵引分子又不动了。
想请教一下各位老师是什么原因呢？

我的mdp文件如下：
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