标题: 请教gromacs选择amber力场后报错Atom CD in residue HYP 2 was not found in rtp... [打印本页] 作者Author: zhilai123 时间: 2023-10-21 10:27 标题: 请教gromacs选择amber力场后报错Atom CD in residue HYP 2 was not found in rtp... 请教各位大佬，应该怎么解决 作者Author: sobereva 时间: 2023-10-22 02:28
pdb/gro文件里HYP残基有叫CD的原子，但rtp文件里HYP残基定义里没有叫CD的原子，对不上。弄清楚CD是什么，结构文件里该改原子名改原子名，跟rtp文件里对应上