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标题: 求问amber的gbsa数据在哪里查，就是Generalized Born的数据 [打印本页]

作者
Author: xxj9618 时间: 2016-9-13 16:30
标题: 求问amber的gbsa数据在哪里查，就是Generalized Born的数据
谢谢大家

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-13 20:18
amber手册igb关键词部分里能看到给出GB参数的文献，在里面找。在源代码里也有GB参数

作者
Author: xxj9618 时间: 2016-9-14 10:37

sobereva 发表于 2016-9-13 20:18
amber手册igb关键词部分里能看到给出GB参数的文献，在里面找。在源代码里也有GB参数

好的，谢谢sob老师。我找找看

作者
Author: xxj9618 时间: 2016-9-18 21:03

sobereva 发表于 2016-9-13 20:18
amber手册igb关键词部分里能看到给出GB参数的文献，在里面找。在源代码里也有GB参数

sob老师我查到了参数，但是gromacs的描述是
[ implicit_genborn_params ]
; atype sar st pi gbr hct
C 0.172 1 1.554 0.17 0.72 ; C
而amber的是α，β，γ和 scaling parameter。该如何对应？

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