计算化学公社

标题: QM/MM方法优化中心分子构型的问题 [打印本页]

作者
Author: SunYiiiiiT 时间: 2023-10-23 22:59
标题: QM/MM方法优化中心分子构型的问题
求助，请问sob老师和其他老师：
1.这篇帖子中提到的QM/MM方法优化中心分子构型的计算是怎么做的呢？
QM/MM方法优化中心分子构型时，输出文件拖入gaussview中发现有多个分子构型
http://bbs.keinsci.com/forum.php ... 26600&fromuid=54159
(出处: 计算化学公社)

2.计算结果是否可以读取中心分子基态时的能量？

3.这篇文献中使用的使用QM/MM模型所做的是否也是这样的结构优化？
https://doi.org/10.1021/jacs.3c08164

作者
Author: sobereva 时间: 2023-10-24 03:56
1 回帖里说了，Gaussian里那叫ONIOM(QM:MM)不叫QM/MM

有ONIOM的常识自然知道怎么做，需要恰当定义layer、原子电荷、不同layer用的计算级别等。优化时可以照常设置原子的冻结，比如冻结簇的外围的那些原子强迫使之保持晶体结构坐标
没ONIOM常识的话，参考http://bbs.keinsci.com/thread-942-1-1.html的4L

2 可以

作者
Author: SunYiiiiiT 时间: 2023-10-24 12:52
好的，谢谢sob老师

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