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标题: Gn等组合方法能直接用于跑irc吗？ [打印本页]

作者
Author: chem413 时间: 2016-9-15 09:32
标题: Gn等组合方法能直接用于跑irc吗？
请问Gn和CBS系列等组合方法能直接用于跑irc吗？
跑irc时irc的选项MW和Cartesian对输出的一阶梯度和二阶梯度输出的数值有影响吗？
两个选项影响的只是效率？
看手册中写的是
Mass-weighted 跟踪质量加权笛卡尔坐标的反应路径
Cartesian 跟踪笛卡尔坐标反应路径，不使用质量加权

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-15 10:28
Gn是用于计算精确的自由能的，操作也是定死的，显然不能跑IRC。如果用Gn做了过渡态，取Gn过程中的优化部分的水平做IRC

作者
Author: chem413 时间: 2016-9-16 08:47

liyuanhe211 发表于 2016-9-15 10:28
Gn是用于计算精确的自由能的，操作也是定死的，显然不能跑IRC。如果用Gn做了过渡态，取Gn过程中的优化部分 ...

那只需要电子能的话就不必要用Gn系列了是吗？
另外请问一下，irc是能量最小反应路径，本身也是采用Gn优化的部分进行irc，然后再进行能量校正。与手动分别先用优化部分跑irc，然后单独取irc上的点进行能量校正区别在哪呢？

作者
Author: liyuanhe211 时间: 2016-9-16 09:17

chem413 发表于 2016-9-16 08:47
那只需要电子能的话就不必要用Gn系列了是吗？
另外请问一下，irc是能量最小反应路径，本身也是采用Gn优 ...

精确的电子能直接用较高级别方法计算单点就完了，和热力学组合方法没关系
“单独取irc上的点进行能量校正”是指什么校正？没这种做法。如果是说热力学校正，IRC一般指的是电子能势能面上的IRC，不是自由能面上的IRC，自由能面上的IRC不太容易获得。如果你说高精度单点能，IRC是势能面性质，不能换用和优化时不同的势能面。

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-16 09:28
Gn和IRC毛关系也没有。
Gn的过程是对初始结构自动进行优化、做振动分析，并以特定方式计算出高精度单点，然后相加得到各种热力学量。
Gn也能给出精度很高的单点能，但给出的是Gn自动优化的结构下的，不是你给定的结构下的。

所以不要把Gn这些热力学组合方法和一般的理论方法混为一谈，热力学组合方法确切来说属于一种“任务”。

作者
Author: chem413 时间: 2016-9-19 14:39

sobereva 发表于 2016-9-16 09:28
Gn和IRC毛关系也没有。
Gn的过程是对初始结构自动进行优化、做振动分析，并以特定方式计算出高精度单点， ...

谢谢之前只是没明白irc是电子能的曲线以为也可以是热力学能的曲线

作者
Author: chem413 时间: 2016-9-19 14:39

liyuanhe211 发表于 2016-9-16 09:17
精确的电子能直接用较高级别方法计算单点就完了，和热力学组合方法没关系
“单独取irc上的点进行能量校 ...

谢谢回复

作者
Author: sobereva 时间: 2016-9-19 20:54

chem413 发表于 2016-9-19 14:39
谢谢之前只是没明白irc是电子能的曲线以为也可以是热力学能的曲线

你可以自行对IRC每个点计算热力学数据也绘制成曲线。IRC上自由能曲线通常在量化里做变分过渡态理论算反应速率才需要。

作者
Author: chem413 时间: 2016-9-20 08:49

sobereva 发表于 2016-9-19 20:54
你可以自行对IRC每个点计算热力学数据也绘制成曲线。IRC上自由能曲线通常在量化里做变分过渡态理论算反应 ...

厉害！高手就是高手啊还没说我想干什么就已经知道了我要干什么了

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