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标题: 求助：multiwfn分析2d指纹图时，是否能得到h-h h-o h-n这种细致的百分比 [打印本页]

作者
Author: WuQs 时间: 2023-10-26 15:21
标题: 求助：multiwfn分析2d指纹图时，是否能得到h-h h-o h-n这种细致的百分比
本帖最后由 WuQs 于 2023-10-27 19:28 编辑

1.最近在学习制作hirshfeld和2d指纹图，发现multiwfn和crystal explore都可以做，因为我根本就不会后者，所以想用前者做，但是我看到别人的图是这样的，
细致到各种类型的键都有，我想咨询multiwfn是否可以这样，如果可以是在哪一步操作哪种类型的键
2.在选择元素的那个选项，我看例子是CL,如果我在此写H，是代表H-H还是所有类型的氢键。

作者
Author: sobereva 时间: 2023-10-27 08:35
Multiwfn被拼错了两次

在选择元素的那个选秀语义不明。Multiwfn手册的例子用的是尿素，没牵扯Cl

每种情况分别定义里、外部分的元素，就能得到相应的接触面积

Multiwfn手册里的例子演示了：

Next, we check the fingerprint plot between the hydrogens in the central urea and the oxygen atom marked by the yellow arrow in above figure. Input the following commands
-1 // Return to upper level of menu
1 // Set the inside atoms to consider
[Press ENTER button] // Do not set constraint for atomic indices
H // The inside atoms must be hydrogen
2 // Set the outside atoms to consider
76 // The index of the oxygen in one of surrounding urea
[Press ENTER button] // Do not set element filter condition
0 // Start fingerprint analysis

作者
Author: WuQs 时间: 2023-10-27 19:20
本帖最后由 WuQs 于 2023-10-27 19:32 编辑

sobereva 发表于 2023-10-27 08:35
Multiwfn被拼错了两次

在选择元素的那个选秀语义不明。Multiwfn手册的例子用的是尿素，没牵扯Cl

不好意思老师，我以后发完贴会再检查一下，纯粹粗粗心没有恶意；我想分析N-H的，N是内部，H是外部。我尝试了您上述的步骤，但是当我的命令是
-1//return to upper level of menu
1//
enter
N//主体分子上的N
2
enter//必须输入H的index吗
H//外面的分子
0//这一步之后闪退

还有个想问的问题，就是如果我在设置内部元素的时候选了H，没有设置外部元素，得到的数据是所有的氢键，还是有默认的元素，比如H-H

作者
Author: WuQs 时间: 2023-10-27 19:26

WuQs 发表于 2023-10-27 19:20
不好意思老师，我以后发完贴会再检查一下，纯粹粗粗心没有恶意；我想分析N-H的，N是内部，H是外部。我尝 ...

又尝试了几次可以了，感谢老师的指导

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