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标题: CP2K算CO频率时NPROC_REP如何设置？ [打印本页]

作者
Author: caiar 时间: 2023-10-29 18:59
标题: CP2K算CO频率时NPROC_REP如何设置？
本帖最后由 caiar 于 2023-10-29 18:59 编辑

各位老师好，我根据卢老师的CP2K讲义在进行振动分析过程中，遇到如下问题：
   起初是按照第一版讲义的133页内容，将&VIBRATIONAL_ANALYSIS中的NPROC_REP设置为1，提交作业后，发现总是中途停止。用卢老师提供的示例结构来跑，完全没问题，经过一系列排除之后，发现是由于我的体系所需盒子太大，具体盒子尺寸为ABC 25 25 25，为了解决这个问题，我尝试将NPROC_REP设置为40，作业可以顺利跑下去。
   但是，有相当一部分结构还是在中途停止，查看报错文件（如下附件slurm-3312156.out）后，发现可能是由于这个作业占用太多服务器资源，所以被迫停止。同时服务器管理员也通知我的作业占据过多资源（通知内容：注意限制程序开的线程数不得超过申请的CPU核数。以下作业每个节点只有24核，但作业开了200多线程，均已杀掉。），我当前使用的服务器为24核。
   我现在不知道该如何更改NPROC_REP了，有没有老师能给出些建议啊

作者
Author: sobereva 时间: 2023-10-30 02:07
用psmp必须自己设OMP_NUM_THREADS，北京科音CP2K第一性原理计算培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KFP_content.html）上我讲"CP2K的基础知识"的部分强调了

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作者
Author: Renhc 时间: 2023-10-30 10:56
个人经验，最好设置为n*n=N（N是调用的核数）

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