计算化学公社

标题: 求助molclus在linux下调用gaussian后错误 [打印本页]

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作者
Author: jilukang    时间: 2023-10-29 16:09
标题: 求助molclus在linux下调用gaussian后错误
具体的报错信息如下

1. Cleaning old output and temporary files...
   
2. Deleting *.out *.chk gauSP*
   
3. All Gaussian temporary files in current folder have been cleaned
   
4. 
   
5.                          *** Configuration     1  ***
   
6. Current date: 2023-10-29   Time: 15:53:34
   
7. Loading geometry         1 from the inputted trajectory file
   
8. Generating gau.gjf...
   
9. Running Gaussian: "/home/ubuntu/sob/gaussian/g16/g16" < gau.gjf > gau.out
   
10. Fine, optimization normally converged
    
11. forrtl: severe (24): end-of-file during read, unit 10, file /home/ubuntu/0-molculs/molclus_1.12_Linux/gau.out
    
12. Image              PC                Routine            Line        Source            
    
13. molclus            000000000041DBEB  Unknown               Unknown  Unknown
    
14. molclus            0000000000445B62  Unknown               Unknown  Unknown
    
15. molclus            0000000000417A5D  Unknown               Unknown  Unknown
    
16. molclus            000000000040BA77  Unknown               Unknown  Unknown
    
17. molclus            0000000000404422  Unknown               Unknown  Unknown
    
18. libc-2.31.so       0000151D2E6DB083  __libc_start_main     Unknown  Unknown
    
19. molclus            0000000000404329  Unknown               Unknown  Unknown
    

复制代码

环境变量配置：
1:  配置
export g16root=/home/ubuntu/sob/gaussian
export GAUSS_SCRDIR=/home/ubuntu/sob/gaussian/g16/scratch
source /home/ubuntu/sob/gaussian/g16/bsd/g16.profile

2：控制台打印变量
ubuntu@ubuntu:~/0-molculs/molclus_1.12_Linux$ echo $g16root
/home/ubuntu/sob/gaussian
ubuntu@ubuntu:~/0-molculs/molclus_1.12_Linux$ echo $GAUSS_EXEDIR
/home/ubuntu/sob/gaussian/g16/bsd:/home/ubuntu/sob/gaussian/g16
ubuntu@ubuntu:~/0-molculs/molclus_1.12_Linux$ echo $gaussian_path（这个没配置）

ubuntu@ubuntu:~/0-molculs/molclus_1.12_Linux$ g16  （g16可以执行）
Entering Gaussian System, Link 0=g16


其他的配置都放到附件中

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作者
Author: 啊不错的飞过海    时间: 2023-10-29 20:29
/home/ubuntu/0-molculs/molclus_1.12_Linux/gau.out还在吗？看样子是读这个时候碰到了未预期的EOF，把这个也传一下，可能是这个文件出了什么问题

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作者
Author: jilukang    时间: 2023-10-29 21:11

啊不错的飞过海 发表于 2023-10-29 20:29
/home/ubuntu/0-molculs/molclus_1.12_Linux/gau.out还在吗？看样子是读这个时候碰到了未预期的EOF，把这个 ...

非常感谢您的回复，已经传上去了，是不是因为少一行而使命令意外结束

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作者
Author: sobereva    时间: 2023-10-30 01:55
不要在标题里手写[Molclus]这种标签。已经给你删了，以后注意

不要写ieneonly，molclus早没这个选项了


gau.out没看出问题。换个简单体系再测试，如果还有问题把traj.xyz和settings.ini一起上传

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作者
Author: jilukang    时间: 2023-11-1 20:18
感谢社长回复，我仔细看了看还是settings里面的问题，把HF= ，设置成了HF= 0, 因此导致最后无法读取能量导致程序中断。现在已经没有问题了。

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