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标题: ORCA的iterativeOptimization使用疑问 [打印本页]

作者
Author: ljc050512 时间: 2023-10-29 22:40
标题: ORCA的iterativeOptimization使用疑问
本帖最后由 ljc050512 于 2023-10-29 23:34 编辑

各位老师好，我在使用orca5.0.3的iterativeOptimization功能时候遇到了问题：我把iterativeOptimization.cmp放到和输入文件一起的目录下；输入文件如下所示，对iterativeOptimization.cmp进行调用；
%maxcore 5000
%pal nprocs 40 end
* xyzfile 0 1 1.xyz
%compound "iterativeOptimization.cmp"
end

我的初始结构文件是1.xyz
【运算时候发现，在优化完得到具有一个小虚频的结构之后，程序并没有继续尝试消除虚频。】
在out文件的末尾是给出了一个警告“Warning: Variable with the name MODES is not a 2D-Array but a second arrayIndex is passed”
后台查看显示，orca还在运行，但是显示只有一个核在运行，也并没有对输出文件有什么改变。
想请各位老师看看我这个文件哪里出错了。
附件是我进行测试的所有计算文件。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-10-29 22:46
同一台机子跑orca说明书里的算例能跑通吗？

作者
Author: ljc050512 时间: 2023-10-29 23:25
本帖最后由 ljc050512 于 2023-10-30 07:53 编辑

wzkchem5 发表于 2023-10-29 22:46
同一台机子跑orca说明书里的算例能跑通吗？

老师好，我试了一下ORCACompoundMethods文件夹里自带的runIterativeOptimization.inp，搭配自带的iterativeOptimization.cmp，在相同的机器上跑了一下，发现报错。相关计算文件已经压缩上传到了这个帖子的附件。
这是输入文件
%maxcore  5000
%pal nprocs  40 end
* int -1 1
C  0  0  0  0.00 0.0 0.0
F  1  0  0  1.60 0.0 0.0
H  1  2  0  1.09 90.0 0.0
H  1  3  2  1.09  120.0 90.0
H  1  4  3  1.09  120.0  180.0
F  1  2  4  1.60  180.0  180.0
*

%compound "iterativeOptimization.cmp"

这是输出文件末尾，报错信息如下：
Analytical frequency calculation...       4.612 sec (= 0.077 min)  20.2 %
Warning: Variable with the name MODES is not a 2D-Array but a second arrayIndex is passed
MatchNewGeometry: Error, Expected '('
Instead found =
[file orca_compound/compound_parser_match_geom.cpp, line 94]:          Wrong syntax in the definition of a new geometry

我在另一台机器上用win版的orca跑了一下runIterativeOptimization.inp，也是同样的报错信息。

作者
Author: wzkchem5 时间: 2023-10-31 23:48

ljc050512 发表于 2023-10-29 16:25
老师好，我试了一下ORCACompoundMethods文件夹里自带的runIterativeOptimization.inp，搭配自带的iterati ...

可以在orca论坛compound script板块（https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewforum.php?f=55）搜一下相关报错

作者
Author: ljc050512 时间: 2023-11-1 17:11

wzkchem5 发表于 2023-10-31 23:48
可以在orca论坛compound script板块（https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewforum.php?f=55）搜一下相关报 ...

好的，谢谢老师！

作者
Author: userrr 时间: 2025-1-23 14:56
你好，楼主，我用orca5.0版本的时候你也遇到过同样的问题，也是和你一样的报错信息，请问楼主解决这个问题了吗，如果解决了，请问是怎么解决的呢，方便说明一下吗，谢谢

作者
Author: wzkchem5 时间: 2025-1-23 16:51

userrr 发表于 2025-1-23 07:56
你好，楼主，我用orca5.0版本的时候你也遇到过同样的问题，也是和你一样的报错信息，请问楼主解决这个问题 ...

改用6.0试试

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