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标题: 如何在真空区域两侧分别添加100气相个水分子 [打印本页]

作者
Author: qiyan 时间: 2023-10-30 09:32
标题: 如何在真空区域两侧分别添加100气相个水分子
在跑完npt后，进行盒子拉伸，产生真空区，如何在真空区域添加100个气相水分子

作者
Author: sobereva 时间: 2023-10-31 06:10
重要信息不要只体现在帖子标题里，必须体现在帖子内容里
光看帖子内容都不知道你非要两侧分别产生100个
没这个要求就用gmx insert-molecules或者gmx solvate或者packmol，都能指定插入的水分子数。有这个要求就用packmol

分子动力学初始结构构建程序Packmol的使用
http://sobereva.com/473（http://bbs.keinsci.com/thread-12549-1-1.html）

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