计算化学公社

标题: QE6.5安装后试跑程序报错 [打印本页]

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Author: Liangyusheng 时间: 2023-10-30 22:37
标题: QE6.5安装后试跑程序报错
各位老师好，最近按照社长的博文Quantum ESPRESSO在Linux下的安装方法 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 (sobereva.com)安装了QE6.5，但是在调用pw.x运行测试文件时出现了报错。报错原因第一行为Program received signal SIGSEGV: Segmentation fault - invalid memory reference.
具体如图，请问各位老师这个怎么解决呢。我google查了下，好像是说有关于内存的问题，但是我看到的其他解答都没有给出一个比较好的解决方法。

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Author: 啊不错的飞过海 时间: 2023-10-30 22:56
可能是MPI编译问题。你用的是什么编译器、什么版本的MPI？
以及，用root干活多少还是有点风险，平时跑计算最好还是搞个普通用户身份。

作者
Author: Liangyusheng 时间: 2023-10-31 00:59

啊不错的飞过海发表于 2023-10-30 22:56
可能是MPI编译问题。你用的是什么编译器、什么版本的MPI？
以及，用root干活多少还是有点风险，平时跑计算 ...

我是之前装过cp2k，装cp2k的时候装的openmpi，用的openmpi4.1.5版本的

作者
Author: Liangyusheng 时间: 2023-10-31 01:02

啊不错的飞过海发表于 2023-10-30 22:56
可能是MPI编译问题。你用的是什么编译器、什么版本的MPI？
以及，用root干活多少还是有点风险，平时跑计算 ...

编译器是gcc，8.5.0版本的

作者
Author: 啊不错的飞过海 时间: 2023-10-31 12:57

Liangyusheng 发表于 2023-10-31 01:02
编译器是gcc，8.5.0版本的

安cp2k/openmpi时候也是用的这个编译吗？
或者说，安cp2k时候有没有用tooolchain安装编译器？可能是编译器版本不匹配导致的，如果有的话尝试用toolchain安的编译器；也可以尝试用mpi随附的mpicc、mpicxx、mpifort。

作者
Author: Liangyusheng 时间: 2023-10-31 16:28

啊不错的飞过海发表于 2023-10-31 12:57
安cp2k/openmpi时候也是用的这个编译吗？
或者说，安cp2k时候有没有用tooolchain安装编译器？可能是编译 ...

是的，安装cp2k之前装了gcc，就这个8.5.0版本的gcc，用于编译。然后是按照社长的cp2k的安装教程安装的，其中关于toolchain是把所有的安装包离线下载好之后，放到../toolchain/build目录下进行的编译和安装

作者
Author: 丁越 时间: 2023-10-31 19:48

Liangyusheng 发表于 2023-10-31 16:28
是的，安装cp2k之前装了gcc，就这个8.5.0版本的gcc，用于编译。然后是按照社长的cp2k的安装教程安装的， ...

建议用intel编译器编译，效率要比GNU编译器高不少。而且别用那么上古的版本.

作者
Author: Liangyusheng 时间: 2023-10-31 21:29

丁越发表于 2023-10-31 19:48
建议用intel编译器编译，效率要比GNU编译器高不少。而且别用那么上古的版本.

好的谢谢

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Author: Riku 时间: 2023-11-18 18:05
现在可以用7.2了

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Author: zj1 时间: 2024-12-29 21:15

Riku 发表于 2023-11-18 18:05
现在可以用7.2了

你好，我们是一个情况，我先按照社长的教程安装了CP2K，又按照教程安装了QE，在用QE计算时scf,nscf和dos都没出现这个问题，但是计算pdos时就出现了这个问题，请问你是怎么解决的呀。

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