计算化学公社

标题: lammps中Muller-Plathe法计算粘度相关问题 [打印本页]

作者
Author:
chemdumpling    时间: 2023-10-31 14:56
标题: lammps中Muller-Plathe法计算粘度相关问题
本人最近刚刚接触MD模拟以及lammps,在网上看模拟到计算粘度相关的教程之后存在如下问题:一般viscocity计算法通常有Muller-Plathe法以及Green-kubo法,但目前来看对于初期学习,Muller-Plathe法较为简便,但是现有教程感觉都并无完整计算流程,本人也参照论文原文Reversing the perturbation in nonequilibrium molecular dynamics: An easy way to calculate
the shear viscosity of fluids进行相关学习,计算粘度时一般参照下图公式:
(, 下载次数 Times of downloads: 31)
但教程中粘度计算部分如下:
compute       layers all chunk/atom bin/1d z center 0.05 units reducedfix           4 all ave/chunk 20 50 1000 layers  vx file velocity_profile.datfix           5 all viscosity 100 x z 20fix           6 nvevariable      dVx equal f_4[11][3]-f_4[1][3]thermo        1000thermo_style  custom step temp press etotal v_dVx f_5 run           50000     















按照本人理解,此过程仅涉及δvx/δz的计算,对其他参量并无描述,请问各位是我的理解有误还是他确实没有将粘度算完?如果部分缺失的话,公式比值上方部分参量应如何计算?


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lue611    时间: 2023-12-28 16:15
请问楼主解决这个问题了吗
作者
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chemdumpling    时间: 2024-1-1 21:39
lue611 发表于 2023-12-28 16:15
请问楼主解决这个问题了吗

基本解决了,不过也是搬运别人的代码
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mumuwang    时间: 2024-1-25 16:32
本帖最后由 mumuwang 于 2024-1-25 16:36 编辑

你好,想加一下vx, 请教一下Muller-Plathe方法粘度的计算,v-x是zls1137132886,非常感谢
作者
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SMJ999    时间: 2024-4-16 20:20
chemdumpling 发表于 2024-1-1 21:39
基本解决了,不过也是搬运别人的代码

你好!可以交流一下MP计算粘度的方法么?可以添加一下VX么?VX:18392102204
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759884279    时间: 2024-5-20 08:45
chemdumpling 发表于 2024-1-1 21:39
基本解决了,不过也是搬运别人的代码

你好,可以请教一下Muller-Plathe方法粘度的计算,VX:zxy759884279,望交流
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Rainy_123    时间: 2024-7-1 20:35
chemdumpling 发表于 2024-1-1 21:39
基本解决了,不过也是搬运别人的代码

您好,请问能请教一下Muller-Plathe方法计算粘度吗,v-x是Rainy-YH,拜托了
作者
Author:
chemdumpling    时间: 2024-7-2 16:38
Rainy_123 发表于 2024-7-1 20:35
您好,请问能请教一下Muller-Plathe方法计算粘度吗,v-x是Rainy-YH,拜托了

本人实践目前看来Muller-Plathe法存在每次在不同初始温度随机数测定下,粘度差距较大,差距大到随温度变化规律性非常差,就算多次测定取平均也只是稍微好一些,你可以试试看大佬的帖子,采用自扩散系数计算粘度,具体应该是爱因斯坦-斯托克斯公式,站里有相关的帖子。




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