使用CP2K培训班里面的Fe.cif,用Multiwfn扩胞后,用gv删除一部分,建立仅有两层铁原子的团簇,且铁原子数量为偶数个(我知道应该至少建立三层,但这里为了图快,就只有两层),在表面放了一个甲烷,冻结底部和四周的铁原子进行优化。
第一个问题:如果不知道体系开壳层闭壳层的话,那么无脑就把金属团簇的原子总数量弄成偶数个,那么该团簇就必然是闭壳层,会省很多事?
第二个问题:直接建立的铁胞体后,有没有必要再进行切割晶胞,将甲烷放在不同的切割面的表面??为什么要切割晶胞?如果不切,直接使用任何一个面作为研究的表面,又会怎么样?如果把甲烷放的距离铁表面比较近或者远,优化都会进行不下去,然而靠化学直觉,把甲烷放在一个合适的位置,则会比较顺利收敛。这个“化学直觉”,对量化新手比较不友好。 (, 下载次数 Times of downloads: 10)
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使用的输入文件如下:
! PBE0 D3 def2-SV(P) def2/J RIJCOSX opt noautostart miniprint nopop
%maxcore 1000
%pal nprocs 6 end
%geom
Constraints
省略***********
end
end
* xyz 0 1 #第三个问题:在CP2K的培训班里,讲到了bcc铁自旋多重度,设了也不起作用,于是我这里也就只设为1,这样究竟合适吗?如果不合适,那么该设置为多少呢?有些文献中,认为单质铁的自旋多重度应该是5,有些文献甚至把铁团簇的自旋多重度设为几十上百都有。如果铁表面放了一个O2分子,那么自旋多重度应该设为3吗?
省略****************
完整的输入文件在此: (, 下载次数 Times of downloads: 1)
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第二个步骤
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2. CPU是13900K,用了6核,优化了35个小时,终于结束,但是没有冻结的铁原子向内部凹陷了。。
第四个问题:按理说,冻结的铁原子当然是稳如泰山,没有冻结的铁原子也应该几乎纹丝不动,但这里明显凹陷了,是因为PBE0不合适吗?如果PBE0不合适优化铁团簇,那用什么级别会更好呢?或者因为团簇不够大吗?或者别的什么原因呢? (, 下载次数 Times of downloads: 9)
*****************************************************
* ERROR *
* SCF NOT CONVERGED AFTER 1230 CYCLES *
*****************************************************
Last Energy change ... 0.0000e+00 Tolerance : 1.0000e-06
Last Orbital Gradient ... 1.8242e-02 Tolerance : 5.0000e-05
Last Orbital Rotation ... 1.9619e-01
--------------------------------------------------------------------
ERROR
This wavefunction IS NOT CONVERGED!
And it is 'too far' from meeting the convergence thresholds.
Aborting ...
Please restart calculation (with larger maxiter?)
--------------------------------------------------------------------
ORCA finished by error termination in SCF
Calling Command: mpirun -np 6 /home/jing/software/orca504/orca_scf_mpi Fe.gbw b Fe
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 465]:
.... aborting the run