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标题: 求助：如何分析随着共溶剂加入离子液体被阴阳离子分开？ [打印本页]

作者
Author: 马天湉 时间: 2023-11-2 20:56
标题: 求助：如何分析随着共溶剂加入离子液体被阴阳离子分开？
我做了不同浓度下（0.5-0.1mol）离子液体与DMSO（0.5-0.9）的动力学模拟；实验结果应该是加入0.9molDMSO时，阴阳离子被DMSO分开，但是IL：DMSO(0.1:0.9)RDF图（阳离子不同位点与阴离子的一个位点或者与dmso的一个原子位点）显示阳离子周围主要分布的还是阴离子；应该通过分析那些数据证明0.1mol离子液体被DMSO分开了?

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-3 03:54
除了查看阳离子原子周围的阴离子原子的rdf外，也同时查看阳离子附近DMSO原子的rdf，看是否随浓度增加有密度提升的趋势。并且DMSO加得浓度比实验更高再看看情况，由于力场精度原因不可能正好吻合实验

作者
Author: 马天湉 时间: 2023-11-8 19:14

sobereva 发表于 2023-11-3 03:54
除了查看阳离子原子周围的阴离子原子的rdf外，也同时查看阳离子附近DMSO原子的rdf，看是否随浓度增加有密度 ...

老师，随着dmso浓度增加，密度是有提升趋势；且不同摩尔比下模拟密度和实验密度误差在3%以内，我又做了0.05mol离子液体和0.95mol的dmso动力学模拟，做了阳离子上H00位点和阴离子上的o05位点的RDF以及阳离子上H00位点和dmso上的o09位点的RDF，发现阳离子上H00位点周围还是阴离子O05分布的多。但是做sdf分析时发现阴阳离子被dmso隔开了为什么rdf会对不上呢老师。

作者
Author: 马天湉 时间: 2023-11-8 19:18
老师这是0.05mol离子液体和0.95moldmso下的rdf图，以及我分析的位点对应的图，因为老师说H00位点阴阳离子之间氢键作用最强如果这个氢键被打破了，则可以证明阴阳离子被dmso分开了，我理解的rdf图应该在这个位点周围分布的dmso应该多余阴离子才能证明阴阳离子被分开了，是吗老师？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-9 17:02

马天湉发表于 2023-11-8 19:18
老师这是0.05mol离子液体和0.95moldmso下的rdf图，以及我分析的位点对应的图，因为老师说H00位点阴阳离子 ...

未必阳离子只有H00处能显著跟阴离子的羧酸根形成显著静电吸引相互作用。至少看一下阳离子的原子电荷判断

当前rdf上至少体现DMSO还没有充分分开阴阳离子

作者
Author: 马天湉 时间: 2023-11-9 18:47

sobereva 发表于 2023-11-9 17:02
未必阳离子只有H00处能显著跟阴离子的羧酸根形成显著静电吸引相互作用。至少看一下阳离子的原子电荷判断
...

感谢老师 H00位点是阳离子中带正电荷最多的原子，羧酸根中两个O带负电一样多，我还分析了其他位点的RDF图都是阳离子与阴离子的峰明显高于阳离子与DMSO的峰，请问老师您说的还没有充分分开是指阳离子与dmso的峰低于阳离子与阴离子之间的峰吗？如果阳离子与dmso的峰高于与阴离子的峰是不是可以证明充分分开了？

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-10 07:08

马天湉发表于 2023-11-9 18:47
感谢老师 H00位点是阳离子中带正电荷最多的原子，羧酸根中两个O带负电一样多，我还分析了其他位点的RDF图 ...

“充分分开”没有统一的界定标准，标准是你自己定义的
A-B严格的充分分开是A附近根本没有B，但从你的图上来看显然不是这样
根据rdf的定义去理解结果

作者
Author: 马天湉 时间: 2023-11-10 08:34

sobereva 发表于 2023-11-10 07:08
“充分分开”没有统一的界定标准，标准是你自己定义的
A-B严格的充分分开是A附近根本没有B，但从你的图 ...

感谢老师

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