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标题: LMOEDA报错问题 [打印本页]

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Author: Are 时间: 2023-11-3 15:16
标题: LMOEDA报错问题
本人利用xacs的xeda计算LMOEDA，输入文件如下，报错信息如下，看完报错信息还是不知道问题所在，求大神指导 (, 下载次数 Times of downloads: 6) (, 下载次数 Times of downloads: 2)

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Author: zjxitcc 时间: 2023-11-3 17:22
你这输入文件看着很奇怪哇，主体内容像是MOKIT的frag_guess_wfn生成的，但前几行被大改了，看上去很不对。建议说明以下信息：
（1）做了什么修改，为何要改（frag_guess_wfn自动生成的文件已经很严谨了，无需修改可直接提交给XEDA）
（2）你想做什么计算？LMO-EDA还是GKS-EDA？如果是前者，那你是想做基于RHF的，还是MP2的，还是CCSD的？

作者
Author: Are 时间: 2023-11-3 19:27

zjxitcc 发表于 2023-11-3 17:22
你这输入文件看着很奇怪哇，主体内容像是MOKIT的frag_guess_wfn生成的，但前几行被大改了，看上去很不对。 ...

老师，我这个是用fch2inp生成的，然后加了$LMOEDA MATOM(1)=2 51 MCHARG(1)=4 -7 MMULT(1)=1 1 $END（我第一次没加这行命令通进去也是失败了，所以我以为是没有LMOEDA命令的缘故）。因为我不清楚frag_guess_wfn生成的和fch2inp生成的有什么区别，加上我下在了预编译widows版以后发现没办法将fchk拖动到frag_guess_wfn里让它生成inp文件，但fch2inp可以，所以就使用了fch2inp。
老师，我想做LMO-EDA，基于RHF的。还请老师指教，谢谢老师啦

作者
Author: zjxitcc 时间: 2023-11-3 19:48
本帖最后由 zjxitcc 于 2023-11-3 19:52 编辑

Are 发表于 2023-11-3 19:27
老师，我这个是用fch2inp生成的，然后加了$LMOEDA MATOM(1)=2 51 MCHARG(1)=4 -7 MMULT(1)=1 1 $END（我 ...

LMO-EDA和GKS-EDA计算需要有多套轨道，所以需要frag_guess_wfn小程序调用Gaussian做多次计算，然后传多套轨道，并产生关键词和隐式溶剂参数（如果有用到的话）。你喂给fch2inp一个fch文件，这顶多只能传1套轨道，远远不够EDA计算所需，而且当前关键词与自动产生的合理关键词差很远。

建议仔细阅读MOKIT手册https://jeanwsr.gitlab.io/mokit-doc-mdbook/chap5-3.html，先从手册里的示例文件开始学习。另外，基于RHF的LMO-EDA虽然可以算，但无实际意义，精度过于糟糕，现在XEDA里最推荐的是GKS-EDA。

fch2inp只传一套轨道，耗时是瞬间的。而frag_guess_wfn需要调用量化程序做计算然后多次调fch2inp挨个传轨道，时间是不可忽略的（当然，比纯用GAMESS做计算要快）。frag_guess_wfn既可在Windows下使用（不是鼠标拖动，是要写好环境变量然后在命令行里运行之），也可以在Linux下使用，不过为了高效计算起见，还是建议到Linux下使用。

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Author: Are 时间: 2023-11-3 21:17

zjxitcc 发表于 2023-11-3 19:48
LMO-EDA和GKS-EDA计算需要有多套轨道，所以需要frag_guess_wfn小程序调用Gaussian做多次计算，然后传多套 ...

感谢老师的回复。阅读完手册还是有个问题想问老师，~/.bashrc这个文件是需要下载Python3才能找到吗？

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Author: zjxitcc 时间: 2023-11-3 21:30

Are 发表于 2023-11-3 21:17
感谢老师的回复。阅读完手册还是有个问题想问老师，~/.bashrc这个文件是需要下载Python3才能找到吗？

这属于Linux基本常识问题，与python无关。~/.bashrc文件是Linux系统自带的、给每个用户的环境变量配置文件。

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