计算化学公社

标题: CP2K晶胞优化后如何获得CIF格式文件 [打印本页]

作者
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Geocmpt    时间: 2023-11-3 20:07
标题: CP2K晶胞优化后如何获得CIF格式文件
本人刚接触CP2K不久,请教各位一个很小白的问题。我用CP2K对晶胞优化后,可以从输出文件log(或out)文件中读出晶胞参数,但是原子坐标都是笛尔卡坐标,如何转换成分数坐标,形成CIF文件啊?

作者
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丁越    时间: 2023-11-3 20:37
本帖最后由 丁越 于 2023-11-3 20:39 编辑

让Multiwfn载入xxx-1.restart文件,主功能100->2->33便可导出为cif文件。

或者将该restart文件载入ASE,运行ase gui xxx-1.restart,在ASE的gui里保存为cif也行。

作者
Author:
Geocmpt    时间: 2023-11-3 20:39
丁越 发表于 2023-11-3 20:37
让Multiwfn载入xxx-1.restart文件,主功能100->2->33便可导出为cif文件。

收到,很感谢您。
作者
Author:
XYDlms    时间: 2024-12-27 10:10
丁越 发表于 2023-11-3 20:37
让Multiwfn载入xxx-1.restart文件,主功能100->2->33便可导出为cif文件。

或者将该restart文件载入ASE, ...

丁老师,想请教一下:
cp2k做结构优化产生的.restart文件是最后一步优化的结果吗?我看输入文件里print后面也没有设置多少步更新restart文件
作者
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Uus/pMeC6H4-/キ    时间: 2024-12-27 10:52
XYDlms 发表于 2024-12-27 10:10
丁老师,想请教一下:
cp2k做结构优化产生的.restart文件是最后一步优化的结果吗?我看输入文件里print ...

.restart文件的更新频率由&MOTION/&PRINT/&RESTART/&EACH字段控制,对几何优化和变胞优化默认都是1(而对分子动力学默认20)。不放心的话检查.restart文件里STEP_START_VAL标的步数和.out文件里优化完成的步数确认。
作者
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XYDlms    时间: 2024-12-28 22:17
Uus/pMeC6H4-/キ 发表于 2024-12-27 10:52
.restart文件的更新频率由&MOTION/&PRINT/&RESTART/&EACH字段控制,对几何优化和变胞优化默认都是1(而对 ...

了解了 谢谢丁老师




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