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标题: 求助：如何计算模拟之后两个氨基酸的Ca随着时间的距离变化 [打印本页]

作者
Author: qiaozhao 时间: 2023-11-3 22:21
标题: 求助：如何计算模拟之后两个氨基酸的Ca随着时间的距离变化
我现在做完了一次模拟，想要得到两个氨基酸的αC的距离随着我模拟时间的变化而变化的数值，请问大家要怎么提取啊，我不会写那个select命令，谢谢各位大佬

作者
Author: yxdd98 时间: 2023-11-3 23:36
把模拟轨迹拖到VMD里，可以绘制指定原子间距离随模拟时间变化情况

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-4 09:12
根本不需要任何命令就可以实现。北京科音分子动力学与GROMACS培训班（http://www.keinsci.com/workshop/KGMX_content.html）里讲了

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