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标题: 构建蛋白盐溶液体系中，在添加离子后进行能量最小化遇到离子不匹配该怎么解决？ [打印本页]

作者
Author: maojunlong 时间: 2023-11-4 15:58
标题: 构建蛋白盐溶液体系中，在添加离子后进行能量最小化遇到离子不匹配该怎么解决？
各位老师好，我在根据gromacs教程（Lysozyme in Water）进行构建蛋白溶液中，添加指定的离子浓度对应的数量后，进行能量最小化的时候，遇到了以下警告提示， (, 下载次数 Times of downloads: 15) 检查了top文件和org文件发现，应该是序号不对应，但是，我根据top文件中[ molecules ]计算发现对应数量没问题，所以这个问题该怎么解决。以下是我的top文件和org文件（文件太大进行压缩了）。谢谢

作者
Author: sobereva 时间: 2023-11-5 12:39
不用管
原子顺序对应就行，不需要原子名对应

作者
Author: LiuSX 时间: 2023-11-6 09:29
-maxwarn 1

作者
Author: maojunlong 时间: 2023-11-6 15:37
谢谢sob老师和LiuSX老师的指点

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